Protein–RNA interactions for Protein: P01906

HLA-DQA2, HLA class II histocompatibility antigen, DQ alpha 2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQA2P01906 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DQA2P01906 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DQA2P01906 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DQA2P01906 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DQA2P01906 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DQA2P01906 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DQA2P01906 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DQA2P01906 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DQA2P01906 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DQA2P01906 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DQA2P01906 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DQA2P01906 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DQA2P01906 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DQA2P01906 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DQA2P01906 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DQA2P01906 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DQA2P01906 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DQA2P01906 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DQA2P01906 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DQA2P01906 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DQA2P01906 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DQA2P01906 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DQA2P01906 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DQA2P01906 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DQA2P01906 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DQA2P01906 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DQA2P01906 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DQA2P01906 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DQA2P01906 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-DQA2P01906 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-DQA2P01906 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-DQA2P01906 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-DQA2P01906 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DQA2P01906 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DQA2P01906 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DQA2P01906 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DQA2P01906 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DQA2P01906 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DQA2P01906 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DQA2P01906 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DQA2P01906 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HLA-DQA2P01906 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HLA-DQA2P01906 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DQA2P01906 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DQA2P01906 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DQA2P01906 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DQA2P01906 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DQA2P01906 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DQA2P01906 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DQA2P01906 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DQA2P01906 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DQA2P01906 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DQA2P01906 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DQA2P01906 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DQA2P01906 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DQA2P01906 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DQA2P01906 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DQA2P01906 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DQA2P01906 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DQA2P01906 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DQA2P01906 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DQA2P01906 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DQA2P01906 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DQA2P01906 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DQA2P01906 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DQA2P01906 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DQA2P01906 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DQA2P01906 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DQA2P01906 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DQA2P01906 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DQA2P01906 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DQA2P01906 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DQA2P01906 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DQA2P01906 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DQA2P01906 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DQA2P01906 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DQA2P01906 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DQA2P01906 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HLA-DQA2P01906 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DQA2P01906 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DQA2P01906 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DQA2P01906 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DQA2P01906 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DQA2P01906 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DQA2P01906 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DQA2P01906 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DQA2P01906 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DQA2P01906 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DQA2P01906 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DQA2P01906 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DQA2P01906 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DQA2P01906 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DQA2P01906 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DQA2P01906 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DQA2P01906 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DQA2P01906 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DQA2P01906 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DQA2P01906 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DQA2P01906 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DQA2P01906 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms