Protein–RNA interactions for Protein: P01857

IGHG1, Immunoglobulin heavy constant gamma 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHG1P01857 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHG1P01857 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHG1P01857 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHG1P01857 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHG1P01857 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHG1P01857 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHG1P01857 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHG1P01857 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHG1P01857 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHG1P01857 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHG1P01857 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHG1P01857 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGHG1P01857 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGHG1P01857 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGHG1P01857 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGHG1P01857 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGHG1P01857 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGHG1P01857 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGHG1P01857 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGHG1P01857 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGHG1P01857 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGHG1P01857 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGHG1P01857 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IGHG1P01857 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGHG1P01857 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGHG1P01857 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGHG1P01857 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGHG1P01857 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGHG1P01857 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGHG1P01857 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGHG1P01857 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGHG1P01857 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGHG1P01857 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGHG1P01857 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHG1P01857 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHG1P01857 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHG1P01857 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHG1P01857 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHG1P01857 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHG1P01857 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHG1P01857 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHG1P01857 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHG1P01857 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHG1P01857 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHG1P01857 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHG1P01857 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHG1P01857 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHG1P01857 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHG1P01857 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHG1P01857 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHG1P01857 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHG1P01857 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHG1P01857 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHG1P01857 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHG1P01857 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHG1P01857 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHG1P01857 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHG1P01857 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHG1P01857 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHG1P01857 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHG1P01857 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHG1P01857 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHG1P01857 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
IGHG1P01857 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGHG1P01857 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IGHG1P01857 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IGHG1P01857 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGHG1P01857 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGHG1P01857 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGHG1P01857 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGHG1P01857 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGHG1P01857 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGHG1P01857 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGHG1P01857 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGHG1P01857 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGHG1P01857 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGHG1P01857 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGHG1P01857 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGHG1P01857 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGHG1P01857 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGHG1P01857 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGHG1P01857 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IGHG1P01857 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IGHG1P01857 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGHG1P01857 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGHG1P01857 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGHG1P01857 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGHG1P01857 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGHG1P01857 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGHG1P01857 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGHG1P01857 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGHG1P01857 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGHG1P01857 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGHG1P01857 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGHG1P01857 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGHG1P01857 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGHG1P01857 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGHG1P01857 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGHG1P01857 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGHG1P01857 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.8 ms