Protein–RNA interactions for Protein: P00736

C1R, Complement C1r subcomponent, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1RP00736 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
C1RP00736 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
C1RP00736 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
C1RP00736 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
C1RP00736 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
C1RP00736 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C1RP00736 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C1RP00736 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
C1RP00736 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C1RP00736 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
C1RP00736 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
C1RP00736 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C1RP00736 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C1RP00736 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C1RP00736 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C1RP00736 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
C1RP00736 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
C1RP00736 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C1RP00736 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C1RP00736 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C1RP00736 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C1RP00736 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C1RP00736 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C1RP00736 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
C1RP00736 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C1RP00736 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
C1RP00736 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C1RP00736 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C1RP00736 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
C1RP00736 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
C1RP00736 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
C1RP00736 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
C1RP00736 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
C1RP00736 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C1RP00736 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
C1RP00736 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
C1RP00736 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
C1RP00736 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
C1RP00736 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
C1RP00736 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
C1RP00736 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C1RP00736 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
C1RP00736 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
C1RP00736 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
C1RP00736 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
C1RP00736 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
C1RP00736 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
C1RP00736 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
C1RP00736 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
C1RP00736 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
C1RP00736 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C1RP00736 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
C1RP00736 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C1RP00736 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
C1RP00736 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C1RP00736 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
C1RP00736 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
C1RP00736 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
C1RP00736 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
C1RP00736 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
C1RP00736 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
C1RP00736 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
C1RP00736 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
C1RP00736 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
C1RP00736 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
C1RP00736 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
C1RP00736 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
C1RP00736 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
C1RP00736 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
C1RP00736 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
C1RP00736 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
C1RP00736 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
C1RP00736 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
C1RP00736 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
C1RP00736 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
C1RP00736 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
C1RP00736 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
C1RP00736 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
C1RP00736 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
C1RP00736 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
C1RP00736 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
C1RP00736 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
C1RP00736 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
C1RP00736 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
C1RP00736 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
C1RP00736 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
C1RP00736 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
C1RP00736 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
C1RP00736 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
C1RP00736 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
C1RP00736 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
C1RP00736 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.8
C1RP00736 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
C1RP00736 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
C1RP00736 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
C1RP00736 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
C1RP00736 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
C1RP00736 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
C1RP00736 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
C1RP00736 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms