Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NSD2O96028 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NSD2O96028 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NSD2O96028 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NSD2O96028 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NSD2O96028 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NSD2O96028 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NSD2O96028 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
NSD2O96028 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
NSD2O96028 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
NSD2O96028 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
NSD2O96028 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
NSD2O96028 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NSD2O96028 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NSD2O96028 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NSD2O96028 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NSD2O96028 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NSD2O96028 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NSD2O96028 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NSD2O96028 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NSD2O96028 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NSD2O96028 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NSD2O96028 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NSD2O96028 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
NSD2O96028 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NSD2O96028 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NSD2O96028 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NSD2O96028 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
NSD2O96028 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
NSD2O96028 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.04
NSD2O96028 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
NSD2O96028 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.04
NSD2O96028 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
NSD2O96028 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
NSD2O96028 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
NSD2O96028 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NSD2O96028 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NSD2O96028 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
NSD2O96028 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NSD2O96028 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NSD2O96028 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NSD2O96028 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
NSD2O96028 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NSD2O96028 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NSD2O96028 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
NSD2O96028 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NSD2O96028 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NSD2O96028 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NSD2O96028 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
NSD2O96028 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NSD2O96028 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NSD2O96028 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
NSD2O96028 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
NSD2O96028 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
NSD2O96028 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NSD2O96028 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NSD2O96028 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
NSD2O96028 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
NSD2O96028 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NSD2O96028 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NSD2O96028 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NSD2O96028 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NSD2O96028 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NSD2O96028 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
NSD2O96028 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
NSD2O96028 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NSD2O96028 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NSD2O96028 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NSD2O96028 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NSD2O96028 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NSD2O96028 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NSD2O96028 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NSD2O96028 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NSD2O96028 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
NSD2O96028 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NSD2O96028 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NSD2O96028 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NSD2O96028 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NSD2O96028 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
NSD2O96028 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
NSD2O96028 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
NSD2O96028 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NSD2O96028 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NSD2O96028 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NSD2O96028 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NSD2O96028 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NSD2O96028 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NSD2O96028 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NSD2O96028 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC33.79■■■■□ 3
NSD2O96028 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC33.78■■■■□ 3
NSD2O96028 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
NSD2O96028 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
NSD2O96028 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NSD2O96028 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NSD2O96028 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
NSD2O96028 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NSD2O96028 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
NSD2O96028 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
NSD2O96028 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
NSD2O96028 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms