Protein–RNA interactions for Protein: O96019

ACTL6A, Actin-like protein 6A, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTL6AO96019 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTL6AO96019 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTL6AO96019 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTL6AO96019 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTL6AO96019 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTL6AO96019 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTL6AO96019 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTL6AO96019 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTL6AO96019 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTL6AO96019 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTL6AO96019 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTL6AO96019 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTL6AO96019 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTL6AO96019 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTL6AO96019 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTL6AO96019 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTL6AO96019 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTL6AO96019 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTL6AO96019 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTL6AO96019 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTL6AO96019 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTL6AO96019 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTL6AO96019 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTL6AO96019 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTL6AO96019 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTL6AO96019 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTL6AO96019 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTL6AO96019 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTL6AO96019 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTL6AO96019 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTL6AO96019 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTL6AO96019 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTL6AO96019 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTL6AO96019 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTL6AO96019 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTL6AO96019 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTL6AO96019 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTL6AO96019 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTL6AO96019 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTL6AO96019 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTL6AO96019 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTL6AO96019 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTL6AO96019 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ACTL6AO96019 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTL6AO96019 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTL6AO96019 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTL6AO96019 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTL6AO96019 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTL6AO96019 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTL6AO96019 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTL6AO96019 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTL6AO96019 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTL6AO96019 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTL6AO96019 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTL6AO96019 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTL6AO96019 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTL6AO96019 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTL6AO96019 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTL6AO96019 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTL6AO96019 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTL6AO96019 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTL6AO96019 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTL6AO96019 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTL6AO96019 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTL6AO96019 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTL6AO96019 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTL6AO96019 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTL6AO96019 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTL6AO96019 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTL6AO96019 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTL6AO96019 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTL6AO96019 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTL6AO96019 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACTL6AO96019 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACTL6AO96019 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTL6AO96019 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTL6AO96019 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTL6AO96019 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTL6AO96019 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTL6AO96019 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTL6AO96019 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTL6AO96019 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTL6AO96019 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTL6AO96019 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTL6AO96019 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTL6AO96019 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTL6AO96019 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTL6AO96019 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTL6AO96019 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTL6AO96019 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTL6AO96019 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTL6AO96019 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTL6AO96019 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTL6AO96019 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTL6AO96019 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTL6AO96019 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTL6AO96019 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTL6AO96019 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTL6AO96019 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTL6AO96019 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms