Protein–RNA interactions for Protein: O95900

TRUB2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase TRUB2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRUB2O95900 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRUB2O95900 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRUB2O95900 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRUB2O95900 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRUB2O95900 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRUB2O95900 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRUB2O95900 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRUB2O95900 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRUB2O95900 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRUB2O95900 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRUB2O95900 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRUB2O95900 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRUB2O95900 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRUB2O95900 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
TRUB2O95900 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRUB2O95900 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRUB2O95900 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRUB2O95900 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRUB2O95900 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRUB2O95900 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRUB2O95900 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRUB2O95900 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRUB2O95900 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRUB2O95900 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRUB2O95900 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRUB2O95900 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRUB2O95900 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRUB2O95900 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRUB2O95900 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRUB2O95900 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRUB2O95900 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRUB2O95900 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRUB2O95900 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRUB2O95900 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRUB2O95900 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRUB2O95900 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRUB2O95900 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRUB2O95900 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRUB2O95900 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRUB2O95900 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRUB2O95900 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRUB2O95900 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRUB2O95900 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRUB2O95900 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRUB2O95900 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRUB2O95900 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRUB2O95900 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRUB2O95900 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRUB2O95900 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRUB2O95900 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRUB2O95900 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRUB2O95900 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRUB2O95900 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRUB2O95900 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRUB2O95900 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRUB2O95900 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRUB2O95900 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRUB2O95900 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRUB2O95900 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRUB2O95900 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TRUB2O95900 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRUB2O95900 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRUB2O95900 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRUB2O95900 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRUB2O95900 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRUB2O95900 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRUB2O95900 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRUB2O95900 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRUB2O95900 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRUB2O95900 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRUB2O95900 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRUB2O95900 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRUB2O95900 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRUB2O95900 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRUB2O95900 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRUB2O95900 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRUB2O95900 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRUB2O95900 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRUB2O95900 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRUB2O95900 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRUB2O95900 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRUB2O95900 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRUB2O95900 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRUB2O95900 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRUB2O95900 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRUB2O95900 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRUB2O95900 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRUB2O95900 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRUB2O95900 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRUB2O95900 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRUB2O95900 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRUB2O95900 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRUB2O95900 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRUB2O95900 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRUB2O95900 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRUB2O95900 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRUB2O95900 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRUB2O95900 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRUB2O95900 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRUB2O95900 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms