Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
DDX58O95786 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
DDX58O95786 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
DDX58O95786 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
DDX58O95786 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
DDX58O95786 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
DDX58O95786 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
DDX58O95786 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
DDX58O95786 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
DDX58O95786 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
DDX58O95786 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
DDX58O95786 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
DDX58O95786 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
DDX58O95786 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
DDX58O95786 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
DDX58O95786 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
DDX58O95786 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
DDX58O95786 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
DDX58O95786 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
DDX58O95786 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
DDX58O95786 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
DDX58O95786 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
DDX58O95786 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
DDX58O95786 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
DDX58O95786 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
DDX58O95786 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
DDX58O95786 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
DDX58O95786 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
DDX58O95786 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
DDX58O95786 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
DDX58O95786 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
DDX58O95786 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
DDX58O95786 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
DDX58O95786 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
DDX58O95786 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
DDX58O95786 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
DDX58O95786 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
DDX58O95786 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
DDX58O95786 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
DDX58O95786 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
DDX58O95786 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC31.67■■■□□ 2.66
DDX58O95786 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
DDX58O95786 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
DDX58O95786 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
DDX58O95786 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
DDX58O95786 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
DDX58O95786 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
DDX58O95786 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
DDX58O95786 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
DDX58O95786 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
DDX58O95786 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
DDX58O95786 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
DDX58O95786 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
DDX58O95786 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
DDX58O95786 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
DDX58O95786 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
DDX58O95786 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
DDX58O95786 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
DDX58O95786 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
DDX58O95786 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
DDX58O95786 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
DDX58O95786 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
DDX58O95786 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
DDX58O95786 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
DDX58O95786 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
DDX58O95786 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
DDX58O95786 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
DDX58O95786 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
DDX58O95786 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
DDX58O95786 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
DDX58O95786 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
DDX58O95786 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
DDX58O95786 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
DDX58O95786 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
DDX58O95786 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
DDX58O95786 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
DDX58O95786 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
DDX58O95786 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
DDX58O95786 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
DDX58O95786 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
DDX58O95786 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
DDX58O95786 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
DDX58O95786 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
DDX58O95786 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
DDX58O95786 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
DDX58O95786 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
DDX58O95786 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
DDX58O95786 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
DDX58O95786 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
DDX58O95786 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
DDX58O95786 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
DDX58O95786 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
DDX58O95786 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.63
DDX58O95786 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
DDX58O95786 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
DDX58O95786 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
DDX58O95786 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
DDX58O95786 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
DDX58O95786 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
DDX58O95786 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms