Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CBX6O95503 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CBX6O95503 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CBX6O95503 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CBX6O95503 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CBX6O95503 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CBX6O95503 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CBX6O95503 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CBX6O95503 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CBX6O95503 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CBX6O95503 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CBX6O95503 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CBX6O95503 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CBX6O95503 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CBX6O95503 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBX6O95503 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CBX6O95503 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBX6O95503 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBX6O95503 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBX6O95503 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CBX6O95503 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBX6O95503 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CBX6O95503 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CBX6O95503 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CBX6O95503 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CBX6O95503 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CBX6O95503 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CBX6O95503 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CBX6O95503 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CBX6O95503 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CBX6O95503 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CBX6O95503 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CBX6O95503 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CBX6O95503 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CBX6O95503 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CBX6O95503 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CBX6O95503 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CBX6O95503 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CBX6O95503 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CBX6O95503 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CBX6O95503 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CBX6O95503 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CBX6O95503 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CBX6O95503 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CBX6O95503 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CBX6O95503 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CBX6O95503 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CBX6O95503 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CBX6O95503 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CBX6O95503 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CBX6O95503 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CBX6O95503 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CBX6O95503 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CBX6O95503 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CBX6O95503 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CBX6O95503 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CBX6O95503 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CBX6O95503 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CBX6O95503 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CBX6O95503 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CBX6O95503 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CBX6O95503 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CBX6O95503 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CBX6O95503 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CBX6O95503 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CBX6O95503 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CBX6O95503 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBX6O95503 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBX6O95503 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBX6O95503 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBX6O95503 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBX6O95503 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBX6O95503 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBX6O95503 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBX6O95503 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CBX6O95503 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBX6O95503 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBX6O95503 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBX6O95503 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CBX6O95503 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CBX6O95503 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CBX6O95503 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CBX6O95503 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CBX6O95503 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CBX6O95503 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CBX6O95503 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CBX6O95503 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CBX6O95503 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CBX6O95503 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CBX6O95503 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CBX6O95503 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CBX6O95503 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CBX6O95503 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CBX6O95503 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CBX6O95503 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CBX6O95503 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CBX6O95503 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CBX6O95503 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CBX6O95503 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CBX6O95503 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms