Protein–RNA interactions for Protein: O95096

NKX2-2, Homeobox protein Nkx-2.2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-2O95096 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKX2-2O95096 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKX2-2O95096 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKX2-2O95096 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKX2-2O95096 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NKX2-2O95096 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKX2-2O95096 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKX2-2O95096 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKX2-2O95096 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKX2-2O95096 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKX2-2O95096 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKX2-2O95096 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKX2-2O95096 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKX2-2O95096 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NKX2-2O95096 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKX2-2O95096 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKX2-2O95096 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKX2-2O95096 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKX2-2O95096 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NKX2-2O95096 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKX2-2O95096 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKX2-2O95096 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKX2-2O95096 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX2-2O95096 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX2-2O95096 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX2-2O95096 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX2-2O95096 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX2-2O95096 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX2-2O95096 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NKX2-2O95096 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NKX2-2O95096 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NKX2-2O95096 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NKX2-2O95096 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NKX2-2O95096 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NKX2-2O95096 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NKX2-2O95096 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
NKX2-2O95096 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NKX2-2O95096 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKX2-2O95096 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKX2-2O95096 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKX2-2O95096 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKX2-2O95096 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKX2-2O95096 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NKX2-2O95096 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKX2-2O95096 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKX2-2O95096 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKX2-2O95096 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKX2-2O95096 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKX2-2O95096 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKX2-2O95096 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKX2-2O95096 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKX2-2O95096 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKX2-2O95096 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKX2-2O95096 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKX2-2O95096 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKX2-2O95096 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKX2-2O95096 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKX2-2O95096 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKX2-2O95096 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX2-2O95096 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX2-2O95096 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX2-2O95096 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX2-2O95096 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX2-2O95096 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX2-2O95096 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX2-2O95096 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKX2-2O95096 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKX2-2O95096 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NKX2-2O95096 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKX2-2O95096 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKX2-2O95096 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKX2-2O95096 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKX2-2O95096 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKX2-2O95096 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKX2-2O95096 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKX2-2O95096 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NKX2-2O95096 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NKX2-2O95096 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NKX2-2O95096 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NKX2-2O95096 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NKX2-2O95096 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NKX2-2O95096 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKX2-2O95096 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKX2-2O95096 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKX2-2O95096 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKX2-2O95096 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKX2-2O95096 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKX2-2O95096 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKX2-2O95096 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKX2-2O95096 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKX2-2O95096 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKX2-2O95096 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKX2-2O95096 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKX2-2O95096 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKX2-2O95096 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKX2-2O95096 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKX2-2O95096 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKX2-2O95096 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NKX2-2O95096 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKX2-2O95096 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms