Protein–RNA interactions for Protein: O94907

DKK1, Dickkopf-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK1O94907 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DKK1O94907 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DKK1O94907 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DKK1O94907 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DKK1O94907 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DKK1O94907 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DKK1O94907 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DKK1O94907 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DKK1O94907 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DKK1O94907 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DKK1O94907 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DKK1O94907 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DKK1O94907 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DKK1O94907 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DKK1O94907 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DKK1O94907 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DKK1O94907 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DKK1O94907 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
DKK1O94907 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DKK1O94907 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DKK1O94907 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
DKK1O94907 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DKK1O94907 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DKK1O94907 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DKK1O94907 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DKK1O94907 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
DKK1O94907 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DKK1O94907 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DKK1O94907 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DKK1O94907 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DKK1O94907 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DKK1O94907 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DKK1O94907 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DKK1O94907 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DKK1O94907 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DKK1O94907 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DKK1O94907 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DKK1O94907 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DKK1O94907 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DKK1O94907 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DKK1O94907 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DKK1O94907 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DKK1O94907 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DKK1O94907 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DKK1O94907 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DKK1O94907 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DKK1O94907 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DKK1O94907 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DKK1O94907 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DKK1O94907 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DKK1O94907 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DKK1O94907 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DKK1O94907 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DKK1O94907 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DKK1O94907 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DKK1O94907 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DKK1O94907 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DKK1O94907 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DKK1O94907 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DKK1O94907 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DKK1O94907 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DKK1O94907 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DKK1O94907 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
DKK1O94907 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DKK1O94907 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
DKK1O94907 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DKK1O94907 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DKK1O94907 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DKK1O94907 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DKK1O94907 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DKK1O94907 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DKK1O94907 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DKK1O94907 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DKK1O94907 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DKK1O94907 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DKK1O94907 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DKK1O94907 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DKK1O94907 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DKK1O94907 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DKK1O94907 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DKK1O94907 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DKK1O94907 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DKK1O94907 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DKK1O94907 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DKK1O94907 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DKK1O94907 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DKK1O94907 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DKK1O94907 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DKK1O94907 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DKK1O94907 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DKK1O94907 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DKK1O94907 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DKK1O94907 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DKK1O94907 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DKK1O94907 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
DKK1O94907 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DKK1O94907 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DKK1O94907 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
DKK1O94907 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DKK1O94907 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122 ms