Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ECM2O94769 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ECM2O94769 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ECM2O94769 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ECM2O94769 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ECM2O94769 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ECM2O94769 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ECM2O94769 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ECM2O94769 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ECM2O94769 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ECM2O94769 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ECM2O94769 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ECM2O94769 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ECM2O94769 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ECM2O94769 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ECM2O94769 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
ECM2O94769 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ECM2O94769 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ECM2O94769 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ECM2O94769 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ECM2O94769 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ECM2O94769 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ECM2O94769 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ECM2O94769 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ECM2O94769 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ECM2O94769 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ECM2O94769 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ECM2O94769 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ECM2O94769 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ECM2O94769 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ECM2O94769 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ECM2O94769 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ECM2O94769 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ECM2O94769 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ECM2O94769 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ECM2O94769 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ECM2O94769 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ECM2O94769 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ECM2O94769 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ECM2O94769 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ECM2O94769 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ECM2O94769 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ECM2O94769 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ECM2O94769 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ECM2O94769 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ECM2O94769 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ECM2O94769 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ECM2O94769 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ECM2O94769 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ECM2O94769 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ECM2O94769 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ECM2O94769 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ECM2O94769 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ECM2O94769 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ECM2O94769 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ECM2O94769 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ECM2O94769 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ECM2O94769 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ECM2O94769 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ECM2O94769 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ECM2O94769 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ECM2O94769 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ECM2O94769 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ECM2O94769 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ECM2O94769 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ECM2O94769 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ECM2O94769 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ECM2O94769 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ECM2O94769 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ECM2O94769 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ECM2O94769 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ECM2O94769 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ECM2O94769 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ECM2O94769 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ECM2O94769 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ECM2O94769 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ECM2O94769 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ECM2O94769 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ECM2O94769 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ECM2O94769 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ECM2O94769 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ECM2O94769 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ECM2O94769 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ECM2O94769 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ECM2O94769 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ECM2O94769 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ECM2O94769 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ECM2O94769 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ECM2O94769 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ECM2O94769 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ECM2O94769 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ECM2O94769 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ECM2O94769 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ECM2O94769 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ECM2O94769 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ECM2O94769 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ECM2O94769 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ECM2O94769 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ECM2O94769 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ECM2O94769 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms