Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRMUO75648 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRMUO75648 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRMUO75648 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRMUO75648 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRMUO75648 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRMUO75648 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRMUO75648 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRMUO75648 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRMUO75648 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRMUO75648 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRMUO75648 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRMUO75648 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRMUO75648 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRMUO75648 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRMUO75648 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRMUO75648 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRMUO75648 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRMUO75648 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRMUO75648 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRMUO75648 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRMUO75648 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRMUO75648 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRMUO75648 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRMUO75648 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRMUO75648 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRMUO75648 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRMUO75648 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRMUO75648 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRMUO75648 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRMUO75648 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRMUO75648 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRMUO75648 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRMUO75648 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRMUO75648 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRMUO75648 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRMUO75648 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRMUO75648 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRMUO75648 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRMUO75648 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRMUO75648 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRMUO75648 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRMUO75648 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRMUO75648 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRMUO75648 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRMUO75648 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRMUO75648 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRMUO75648 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRMUO75648 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRMUO75648 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRMUO75648 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRMUO75648 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRMUO75648 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRMUO75648 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRMUO75648 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRMUO75648 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRMUO75648 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRMUO75648 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRMUO75648 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRMUO75648 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRMUO75648 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRMUO75648 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRMUO75648 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRMUO75648 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRMUO75648 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRMUO75648 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRMUO75648 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRMUO75648 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRMUO75648 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRMUO75648 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRMUO75648 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRMUO75648 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRMUO75648 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRMUO75648 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRMUO75648 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRMUO75648 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRMUO75648 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRMUO75648 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRMUO75648 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRMUO75648 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRMUO75648 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRMUO75648 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRMUO75648 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRMUO75648 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRMUO75648 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRMUO75648 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRMUO75648 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRMUO75648 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRMUO75648 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRMUO75648 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRMUO75648 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRMUO75648 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRMUO75648 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRMUO75648 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRMUO75648 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRMUO75648 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRMUO75648 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRMUO75648 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRMUO75648 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRMUO75648 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms