Protein–RNA interactions for Protein: O75427

LRCH4, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH4O75427 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRCH4O75427 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRCH4O75427 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRCH4O75427 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRCH4O75427 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRCH4O75427 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRCH4O75427 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRCH4O75427 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRCH4O75427 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRCH4O75427 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRCH4O75427 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRCH4O75427 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRCH4O75427 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRCH4O75427 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRCH4O75427 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRCH4O75427 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRCH4O75427 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRCH4O75427 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRCH4O75427 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRCH4O75427 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRCH4O75427 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRCH4O75427 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRCH4O75427 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LRCH4O75427 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRCH4O75427 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRCH4O75427 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LRCH4O75427 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRCH4O75427 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRCH4O75427 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRCH4O75427 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRCH4O75427 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRCH4O75427 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRCH4O75427 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRCH4O75427 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRCH4O75427 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRCH4O75427 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRCH4O75427 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
LRCH4O75427 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LRCH4O75427 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LRCH4O75427 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRCH4O75427 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRCH4O75427 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRCH4O75427 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRCH4O75427 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRCH4O75427 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRCH4O75427 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRCH4O75427 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRCH4O75427 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRCH4O75427 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRCH4O75427 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LRCH4O75427 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRCH4O75427 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRCH4O75427 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRCH4O75427 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRCH4O75427 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRCH4O75427 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRCH4O75427 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRCH4O75427 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRCH4O75427 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRCH4O75427 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LRCH4O75427 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRCH4O75427 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRCH4O75427 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRCH4O75427 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRCH4O75427 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
LRCH4O75427 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
LRCH4O75427 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
LRCH4O75427 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRCH4O75427 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRCH4O75427 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRCH4O75427 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRCH4O75427 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRCH4O75427 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LRCH4O75427 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRCH4O75427 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRCH4O75427 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRCH4O75427 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRCH4O75427 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRCH4O75427 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRCH4O75427 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRCH4O75427 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRCH4O75427 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRCH4O75427 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRCH4O75427 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRCH4O75427 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRCH4O75427 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRCH4O75427 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRCH4O75427 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRCH4O75427 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LRCH4O75427 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRCH4O75427 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRCH4O75427 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRCH4O75427 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRCH4O75427 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRCH4O75427 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRCH4O75427 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRCH4O75427 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRCH4O75427 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRCH4O75427 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRCH4O75427 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms