Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PPFIA4O75335 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PPFIA4O75335 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PPFIA4O75335 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PPFIA4O75335 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PPFIA4O75335 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PPFIA4O75335 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PPFIA4O75335 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPFIA4O75335 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPFIA4O75335 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPFIA4O75335 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPFIA4O75335 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPFIA4O75335 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPFIA4O75335 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPFIA4O75335 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPFIA4O75335 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPFIA4O75335 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPFIA4O75335 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPFIA4O75335 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPFIA4O75335 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPFIA4O75335 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPFIA4O75335 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPFIA4O75335 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPFIA4O75335 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPFIA4O75335 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPFIA4O75335 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPFIA4O75335 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPFIA4O75335 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPFIA4O75335 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPFIA4O75335 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPFIA4O75335 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPFIA4O75335 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPFIA4O75335 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPFIA4O75335 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PPFIA4O75335 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPFIA4O75335 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPFIA4O75335 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PPFIA4O75335 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPFIA4O75335 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPFIA4O75335 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PPFIA4O75335 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPFIA4O75335 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PPFIA4O75335 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPFIA4O75335 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPFIA4O75335 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PPFIA4O75335 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPFIA4O75335 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPFIA4O75335 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPFIA4O75335 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPFIA4O75335 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPFIA4O75335 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPFIA4O75335 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPFIA4O75335 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPFIA4O75335 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPFIA4O75335 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPFIA4O75335 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPFIA4O75335 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPFIA4O75335 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPFIA4O75335 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPFIA4O75335 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPFIA4O75335 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PPFIA4O75335 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPFIA4O75335 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPFIA4O75335 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PPFIA4O75335 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PPFIA4O75335 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPFIA4O75335 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PPFIA4O75335 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PPFIA4O75335 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PPFIA4O75335 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PPFIA4O75335 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PPFIA4O75335 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPFIA4O75335 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPFIA4O75335 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPFIA4O75335 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPFIA4O75335 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPFIA4O75335 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PPFIA4O75335 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPFIA4O75335 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPFIA4O75335 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPFIA4O75335 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPFIA4O75335 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PPFIA4O75335 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPFIA4O75335 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPFIA4O75335 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPFIA4O75335 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPFIA4O75335 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPFIA4O75335 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPFIA4O75335 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPFIA4O75335 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PPFIA4O75335 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PPFIA4O75335 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PPFIA4O75335 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PPFIA4O75335 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PPFIA4O75335 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PPFIA4O75335 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPFIA4O75335 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPFIA4O75335 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPFIA4O75335 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPFIA4O75335 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms