Protein–RNA interactions for Protein: O75192

PEX11A, Peroxisomal membrane protein 11A, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX11AO75192 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PEX11AO75192 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PEX11AO75192 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PEX11AO75192 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PEX11AO75192 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PEX11AO75192 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PEX11AO75192 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PEX11AO75192 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PEX11AO75192 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PEX11AO75192 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PEX11AO75192 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PEX11AO75192 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PEX11AO75192 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PEX11AO75192 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PEX11AO75192 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PEX11AO75192 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PEX11AO75192 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PEX11AO75192 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PEX11AO75192 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PEX11AO75192 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PEX11AO75192 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PEX11AO75192 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PEX11AO75192 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PEX11AO75192 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PEX11AO75192 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PEX11AO75192 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PEX11AO75192 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PEX11AO75192 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PEX11AO75192 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PEX11AO75192 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PEX11AO75192 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PEX11AO75192 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PEX11AO75192 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PEX11AO75192 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PEX11AO75192 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PEX11AO75192 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PEX11AO75192 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PEX11AO75192 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PEX11AO75192 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PEX11AO75192 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PEX11AO75192 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PEX11AO75192 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PEX11AO75192 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PEX11AO75192 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PEX11AO75192 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PEX11AO75192 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PEX11AO75192 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PEX11AO75192 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PEX11AO75192 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PEX11AO75192 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PEX11AO75192 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PEX11AO75192 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PEX11AO75192 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PEX11AO75192 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PEX11AO75192 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PEX11AO75192 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PEX11AO75192 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PEX11AO75192 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PEX11AO75192 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PEX11AO75192 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PEX11AO75192 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PEX11AO75192 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PEX11AO75192 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PEX11AO75192 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PEX11AO75192 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PEX11AO75192 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PEX11AO75192 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PEX11AO75192 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PEX11AO75192 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PEX11AO75192 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PEX11AO75192 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PEX11AO75192 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PEX11AO75192 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PEX11AO75192 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PEX11AO75192 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PEX11AO75192 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PEX11AO75192 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PEX11AO75192 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PEX11AO75192 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PEX11AO75192 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PEX11AO75192 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PEX11AO75192 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PEX11AO75192 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PEX11AO75192 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PEX11AO75192 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PEX11AO75192 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PEX11AO75192 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PEX11AO75192 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PEX11AO75192 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PEX11AO75192 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PEX11AO75192 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PEX11AO75192 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PEX11AO75192 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PEX11AO75192 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PEX11AO75192 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PEX11AO75192 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PEX11AO75192 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PEX11AO75192 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PEX11AO75192 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PEX11AO75192 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms