Protein–RNA interactions for Protein: O60869

EDF1, Endothelial differentiation-related factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDF1O60869 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EDF1O60869 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EDF1O60869 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EDF1O60869 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EDF1O60869 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EDF1O60869 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EDF1O60869 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EDF1O60869 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EDF1O60869 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
EDF1O60869 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EDF1O60869 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
EDF1O60869 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EDF1O60869 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EDF1O60869 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EDF1O60869 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EDF1O60869 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDF1O60869 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EDF1O60869 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EDF1O60869 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EDF1O60869 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EDF1O60869 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
EDF1O60869 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EDF1O60869 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EDF1O60869 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
EDF1O60869 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDF1O60869 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDF1O60869 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDF1O60869 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDF1O60869 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDF1O60869 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDF1O60869 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDF1O60869 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDF1O60869 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDF1O60869 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDF1O60869 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDF1O60869 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDF1O60869 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDF1O60869 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDF1O60869 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDF1O60869 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDF1O60869 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDF1O60869 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDF1O60869 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDF1O60869 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDF1O60869 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDF1O60869 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDF1O60869 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
EDF1O60869 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDF1O60869 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDF1O60869 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDF1O60869 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDF1O60869 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDF1O60869 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
EDF1O60869 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDF1O60869 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDF1O60869 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDF1O60869 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDF1O60869 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDF1O60869 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EDF1O60869 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDF1O60869 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDF1O60869 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDF1O60869 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDF1O60869 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDF1O60869 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDF1O60869 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
EDF1O60869 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDF1O60869 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDF1O60869 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDF1O60869 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDF1O60869 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDF1O60869 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDF1O60869 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDF1O60869 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDF1O60869 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EDF1O60869 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDF1O60869 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDF1O60869 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDF1O60869 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDF1O60869 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EDF1O60869 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EDF1O60869 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EDF1O60869 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EDF1O60869 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EDF1O60869 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDF1O60869 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDF1O60869 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDF1O60869 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDF1O60869 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDF1O60869 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDF1O60869 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDF1O60869 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDF1O60869 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDF1O60869 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDF1O60869 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDF1O60869 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDF1O60869 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDF1O60869 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EDF1O60869 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDF1O60869 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms