Protein–RNA interactions for Protein: O60359

CACNG3, Voltage-dependent calcium channel gamma-3 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG3O60359 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNG3O60359 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNG3O60359 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNG3O60359 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNG3O60359 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNG3O60359 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNG3O60359 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNG3O60359 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNG3O60359 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNG3O60359 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNG3O60359 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNG3O60359 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNG3O60359 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNG3O60359 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNG3O60359 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNG3O60359 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNG3O60359 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNG3O60359 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNG3O60359 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNG3O60359 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNG3O60359 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNG3O60359 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CACNG3O60359 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CACNG3O60359 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNG3O60359 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNG3O60359 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNG3O60359 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNG3O60359 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNG3O60359 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNG3O60359 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNG3O60359 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNG3O60359 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNG3O60359 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNG3O60359 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNG3O60359 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNG3O60359 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNG3O60359 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNG3O60359 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNG3O60359 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNG3O60359 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNG3O60359 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNG3O60359 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNG3O60359 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNG3O60359 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNG3O60359 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNG3O60359 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNG3O60359 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CACNG3O60359 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CACNG3O60359 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CACNG3O60359 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CACNG3O60359 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNG3O60359 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNG3O60359 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNG3O60359 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNG3O60359 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNG3O60359 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNG3O60359 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNG3O60359 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNG3O60359 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNG3O60359 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNG3O60359 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNG3O60359 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNG3O60359 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNG3O60359 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNG3O60359 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNG3O60359 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNG3O60359 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNG3O60359 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNG3O60359 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNG3O60359 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNG3O60359 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNG3O60359 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNG3O60359 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNG3O60359 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNG3O60359 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNG3O60359 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNG3O60359 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNG3O60359 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNG3O60359 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNG3O60359 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNG3O60359 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNG3O60359 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNG3O60359 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNG3O60359 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNG3O60359 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNG3O60359 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNG3O60359 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNG3O60359 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNG3O60359 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNG3O60359 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNG3O60359 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNG3O60359 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNG3O60359 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNG3O60359 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNG3O60359 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNG3O60359 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNG3O60359 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNG3O60359 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNG3O60359 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNG3O60359 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms