Protein–RNA interactions for Protein: O43918

AIRE, Autoimmune regulator, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIREO43918 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AIREO43918 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AIREO43918 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AIREO43918 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AIREO43918 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AIREO43918 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AIREO43918 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
AIREO43918 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AIREO43918 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AIREO43918 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AIREO43918 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AIREO43918 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AIREO43918 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AIREO43918 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AIREO43918 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AIREO43918 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AIREO43918 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AIREO43918 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AIREO43918 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
AIREO43918 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AIREO43918 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AIREO43918 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AIREO43918 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AIREO43918 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AIREO43918 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AIREO43918 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AIREO43918 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AIREO43918 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AIREO43918 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
AIREO43918 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
AIREO43918 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AIREO43918 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AIREO43918 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AIREO43918 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AIREO43918 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AIREO43918 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AIREO43918 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AIREO43918 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AIREO43918 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AIREO43918 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AIREO43918 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AIREO43918 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AIREO43918 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
AIREO43918 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AIREO43918 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AIREO43918 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AIREO43918 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AIREO43918 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AIREO43918 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AIREO43918 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AIREO43918 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AIREO43918 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AIREO43918 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AIREO43918 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AIREO43918 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AIREO43918 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AIREO43918 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AIREO43918 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AIREO43918 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AIREO43918 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AIREO43918 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AIREO43918 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AIREO43918 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AIREO43918 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AIREO43918 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AIREO43918 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AIREO43918 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AIREO43918 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AIREO43918 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AIREO43918 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AIREO43918 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AIREO43918 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AIREO43918 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AIREO43918 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AIREO43918 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AIREO43918 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AIREO43918 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AIREO43918 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AIREO43918 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AIREO43918 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AIREO43918 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AIREO43918 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AIREO43918 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AIREO43918 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AIREO43918 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AIREO43918 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AIREO43918 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AIREO43918 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AIREO43918 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AIREO43918 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AIREO43918 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AIREO43918 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AIREO43918 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AIREO43918 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AIREO43918 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AIREO43918 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AIREO43918 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AIREO43918 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AIREO43918 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AIREO43918 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms