Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GATCO43716 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GATCO43716 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GATCO43716 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GATCO43716 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GATCO43716 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GATCO43716 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GATCO43716 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GATCO43716 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GATCO43716 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GATCO43716 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GATCO43716 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GATCO43716 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GATCO43716 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GATCO43716 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GATCO43716 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GATCO43716 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GATCO43716 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GATCO43716 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GATCO43716 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GATCO43716 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GATCO43716 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GATCO43716 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GATCO43716 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GATCO43716 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GATCO43716 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GATCO43716 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GATCO43716 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GATCO43716 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GATCO43716 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GATCO43716 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GATCO43716 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GATCO43716 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GATCO43716 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GATCO43716 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GATCO43716 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GATCO43716 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GATCO43716 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GATCO43716 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GATCO43716 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GATCO43716 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GATCO43716 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GATCO43716 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GATCO43716 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GATCO43716 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GATCO43716 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GATCO43716 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GATCO43716 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GATCO43716 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GATCO43716 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GATCO43716 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GATCO43716 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GATCO43716 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GATCO43716 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GATCO43716 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GATCO43716 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GATCO43716 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GATCO43716 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GATCO43716 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GATCO43716 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GATCO43716 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GATCO43716 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GATCO43716 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GATCO43716 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GATCO43716 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GATCO43716 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GATCO43716 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GATCO43716 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GATCO43716 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GATCO43716 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GATCO43716 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GATCO43716 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GATCO43716 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GATCO43716 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GATCO43716 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GATCO43716 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GATCO43716 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GATCO43716 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GATCO43716 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GATCO43716 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GATCO43716 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GATCO43716 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GATCO43716 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GATCO43716 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GATCO43716 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GATCO43716 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GATCO43716 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GATCO43716 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GATCO43716 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GATCO43716 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GATCO43716 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GATCO43716 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GATCO43716 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GATCO43716 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GATCO43716 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GATCO43716 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GATCO43716 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GATCO43716 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GATCO43716 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GATCO43716 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms