Protein–RNA interactions for Protein: O43674

NDUFB5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFB5O43674 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NDUFB5O43674 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NDUFB5O43674 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDUFB5O43674 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDUFB5O43674 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDUFB5O43674 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDUFB5O43674 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDUFB5O43674 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDUFB5O43674 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDUFB5O43674 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDUFB5O43674 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDUFB5O43674 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NDUFB5O43674 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDUFB5O43674 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDUFB5O43674 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDUFB5O43674 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDUFB5O43674 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDUFB5O43674 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDUFB5O43674 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NDUFB5O43674 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NDUFB5O43674 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDUFB5O43674 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDUFB5O43674 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDUFB5O43674 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDUFB5O43674 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDUFB5O43674 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDUFB5O43674 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDUFB5O43674 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDUFB5O43674 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDUFB5O43674 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDUFB5O43674 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDUFB5O43674 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NDUFB5O43674 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDUFB5O43674 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDUFB5O43674 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDUFB5O43674 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NDUFB5O43674 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NDUFB5O43674 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NDUFB5O43674 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDUFB5O43674 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NDUFB5O43674 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDUFB5O43674 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDUFB5O43674 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDUFB5O43674 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDUFB5O43674 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDUFB5O43674 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NDUFB5O43674 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDUFB5O43674 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDUFB5O43674 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDUFB5O43674 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDUFB5O43674 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDUFB5O43674 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDUFB5O43674 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDUFB5O43674 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDUFB5O43674 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDUFB5O43674 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDUFB5O43674 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDUFB5O43674 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDUFB5O43674 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDUFB5O43674 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDUFB5O43674 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDUFB5O43674 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDUFB5O43674 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDUFB5O43674 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDUFB5O43674 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDUFB5O43674 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDUFB5O43674 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDUFB5O43674 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDUFB5O43674 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDUFB5O43674 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDUFB5O43674 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDUFB5O43674 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDUFB5O43674 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDUFB5O43674 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDUFB5O43674 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NDUFB5O43674 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
NDUFB5O43674 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDUFB5O43674 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDUFB5O43674 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDUFB5O43674 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDUFB5O43674 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDUFB5O43674 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDUFB5O43674 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDUFB5O43674 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDUFB5O43674 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDUFB5O43674 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDUFB5O43674 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDUFB5O43674 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDUFB5O43674 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDUFB5O43674 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDUFB5O43674 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDUFB5O43674 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDUFB5O43674 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDUFB5O43674 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDUFB5O43674 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDUFB5O43674 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDUFB5O43674 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDUFB5O43674 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDUFB5O43674 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDUFB5O43674 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms