Protein–RNA interactions for Protein: O43557

TNFSF14, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF14O43557 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFSF14O43557 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFSF14O43557 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFSF14O43557 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFSF14O43557 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFSF14O43557 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFSF14O43557 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFSF14O43557 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFSF14O43557 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFSF14O43557 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TNFSF14O43557 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFSF14O43557 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFSF14O43557 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFSF14O43557 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFSF14O43557 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFSF14O43557 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFSF14O43557 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFSF14O43557 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFSF14O43557 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFSF14O43557 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFSF14O43557 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFSF14O43557 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFSF14O43557 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFSF14O43557 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFSF14O43557 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFSF14O43557 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFSF14O43557 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFSF14O43557 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFSF14O43557 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFSF14O43557 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFSF14O43557 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFSF14O43557 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFSF14O43557 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFSF14O43557 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFSF14O43557 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFSF14O43557 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFSF14O43557 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFSF14O43557 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFSF14O43557 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFSF14O43557 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFSF14O43557 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFSF14O43557 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFSF14O43557 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFSF14O43557 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFSF14O43557 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFSF14O43557 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFSF14O43557 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFSF14O43557 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFSF14O43557 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFSF14O43557 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFSF14O43557 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFSF14O43557 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFSF14O43557 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFSF14O43557 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFSF14O43557 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFSF14O43557 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFSF14O43557 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFSF14O43557 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFSF14O43557 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFSF14O43557 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFSF14O43557 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFSF14O43557 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFSF14O43557 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFSF14O43557 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFSF14O43557 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFSF14O43557 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFSF14O43557 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFSF14O43557 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFSF14O43557 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TNFSF14O43557 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
TNFSF14O43557 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFSF14O43557 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFSF14O43557 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFSF14O43557 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFSF14O43557 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFSF14O43557 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFSF14O43557 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFSF14O43557 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFSF14O43557 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFSF14O43557 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFSF14O43557 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFSF14O43557 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFSF14O43557 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFSF14O43557 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFSF14O43557 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFSF14O43557 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFSF14O43557 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFSF14O43557 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFSF14O43557 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFSF14O43557 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFSF14O43557 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFSF14O43557 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFSF14O43557 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFSF14O43557 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFSF14O43557 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFSF14O43557 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFSF14O43557 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFSF14O43557 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFSF14O43557 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFSF14O43557 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms