Protein–RNA interactions for Protein: O43278

SPINT1, Kunitz-type protease inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINT1O43278 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPINT1O43278 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPINT1O43278 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPINT1O43278 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPINT1O43278 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPINT1O43278 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPINT1O43278 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPINT1O43278 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPINT1O43278 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SPINT1O43278 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPINT1O43278 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPINT1O43278 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPINT1O43278 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPINT1O43278 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPINT1O43278 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPINT1O43278 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPINT1O43278 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPINT1O43278 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPINT1O43278 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPINT1O43278 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPINT1O43278 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPINT1O43278 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPINT1O43278 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPINT1O43278 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPINT1O43278 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPINT1O43278 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPINT1O43278 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPINT1O43278 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPINT1O43278 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPINT1O43278 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPINT1O43278 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SPINT1O43278 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SPINT1O43278 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SPINT1O43278 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPINT1O43278 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPINT1O43278 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPINT1O43278 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPINT1O43278 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPINT1O43278 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPINT1O43278 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPINT1O43278 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPINT1O43278 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPINT1O43278 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPINT1O43278 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPINT1O43278 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPINT1O43278 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPINT1O43278 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPINT1O43278 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPINT1O43278 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPINT1O43278 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPINT1O43278 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPINT1O43278 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SPINT1O43278 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPINT1O43278 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPINT1O43278 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPINT1O43278 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPINT1O43278 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPINT1O43278 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPINT1O43278 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPINT1O43278 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPINT1O43278 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPINT1O43278 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPINT1O43278 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPINT1O43278 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPINT1O43278 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPINT1O43278 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPINT1O43278 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPINT1O43278 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPINT1O43278 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPINT1O43278 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPINT1O43278 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPINT1O43278 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPINT1O43278 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPINT1O43278 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPINT1O43278 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPINT1O43278 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPINT1O43278 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPINT1O43278 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPINT1O43278 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPINT1O43278 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPINT1O43278 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPINT1O43278 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPINT1O43278 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPINT1O43278 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPINT1O43278 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPINT1O43278 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SPINT1O43278 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPINT1O43278 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPINT1O43278 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPINT1O43278 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SPINT1O43278 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPINT1O43278 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPINT1O43278 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPINT1O43278 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPINT1O43278 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPINT1O43278 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPINT1O43278 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPINT1O43278 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SPINT1O43278 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SPINT1O43278 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms