Protein–RNA interactions for Protein: O43196

MSH5, MutS protein homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSH5O43196 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
MSH5O43196 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
MSH5O43196 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
MSH5O43196 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
MSH5O43196 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
MSH5O43196 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
MSH5O43196 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
MSH5O43196 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
MSH5O43196 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
MSH5O43196 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
MSH5O43196 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
MSH5O43196 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
MSH5O43196 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
MSH5O43196 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
MSH5O43196 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
MSH5O43196 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.89
MSH5O43196 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
MSH5O43196 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
MSH5O43196 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
MSH5O43196 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
MSH5O43196 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
MSH5O43196 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
MSH5O43196 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
MSH5O43196 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
MSH5O43196 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
MSH5O43196 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
MSH5O43196 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
MSH5O43196 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
MSH5O43196 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
MSH5O43196 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
MSH5O43196 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
MSH5O43196 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
MSH5O43196 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
MSH5O43196 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
MSH5O43196 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
MSH5O43196 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
MSH5O43196 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
MSH5O43196 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
MSH5O43196 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
MSH5O43196 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
MSH5O43196 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
MSH5O43196 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
MSH5O43196 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
MSH5O43196 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
MSH5O43196 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
MSH5O43196 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
MSH5O43196 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
MSH5O43196 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
MSH5O43196 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
MSH5O43196 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
MSH5O43196 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
MSH5O43196 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
MSH5O43196 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
MSH5O43196 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
MSH5O43196 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
MSH5O43196 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
MSH5O43196 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
MSH5O43196 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.87
MSH5O43196 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
MSH5O43196 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
MSH5O43196 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.86
MSH5O43196 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
MSH5O43196 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
MSH5O43196 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
MSH5O43196 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
MSH5O43196 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
MSH5O43196 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
MSH5O43196 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
MSH5O43196 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
MSH5O43196 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
MSH5O43196 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
MSH5O43196 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
MSH5O43196 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
MSH5O43196 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
MSH5O43196 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
MSH5O43196 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
MSH5O43196 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
MSH5O43196 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
MSH5O43196 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
MSH5O43196 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.85
MSH5O43196 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
MSH5O43196 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
MSH5O43196 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
MSH5O43196 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
MSH5O43196 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
MSH5O43196 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
MSH5O43196 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
MSH5O43196 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
MSH5O43196 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
MSH5O43196 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
MSH5O43196 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
MSH5O43196 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
MSH5O43196 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
MSH5O43196 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
MSH5O43196 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
MSH5O43196 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
MSH5O43196 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
MSH5O43196 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
MSH5O43196 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
MSH5O43196 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms