Protein–RNA interactions for Protein: O15522

NKX2-8, Homeobox protein Nkx-2.8, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-8O15522 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKX2-8O15522 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKX2-8O15522 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKX2-8O15522 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKX2-8O15522 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKX2-8O15522 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKX2-8O15522 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKX2-8O15522 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKX2-8O15522 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKX2-8O15522 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKX2-8O15522 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKX2-8O15522 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKX2-8O15522 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKX2-8O15522 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NKX2-8O15522 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NKX2-8O15522 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NKX2-8O15522 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NKX2-8O15522 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NKX2-8O15522 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NKX2-8O15522 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKX2-8O15522 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKX2-8O15522 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKX2-8O15522 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NKX2-8O15522 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NKX2-8O15522 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKX2-8O15522 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKX2-8O15522 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKX2-8O15522 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKX2-8O15522 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKX2-8O15522 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKX2-8O15522 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NKX2-8O15522 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKX2-8O15522 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKX2-8O15522 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKX2-8O15522 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKX2-8O15522 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKX2-8O15522 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKX2-8O15522 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKX2-8O15522 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKX2-8O15522 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKX2-8O15522 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKX2-8O15522 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKX2-8O15522 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKX2-8O15522 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKX2-8O15522 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKX2-8O15522 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NKX2-8O15522 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKX2-8O15522 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKX2-8O15522 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKX2-8O15522 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NKX2-8O15522 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKX2-8O15522 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKX2-8O15522 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKX2-8O15522 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKX2-8O15522 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKX2-8O15522 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKX2-8O15522 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKX2-8O15522 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKX2-8O15522 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKX2-8O15522 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NKX2-8O15522 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKX2-8O15522 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKX2-8O15522 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKX2-8O15522 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKX2-8O15522 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NKX2-8O15522 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKX2-8O15522 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKX2-8O15522 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKX2-8O15522 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKX2-8O15522 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKX2-8O15522 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKX2-8O15522 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKX2-8O15522 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKX2-8O15522 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKX2-8O15522 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKX2-8O15522 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKX2-8O15522 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKX2-8O15522 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKX2-8O15522 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKX2-8O15522 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKX2-8O15522 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NKX2-8O15522 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NKX2-8O15522 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NKX2-8O15522 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NKX2-8O15522 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NKX2-8O15522 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX2-8O15522 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX2-8O15522 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX2-8O15522 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX2-8O15522 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX2-8O15522 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX2-8O15522 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX2-8O15522 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX2-8O15522 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKX2-8O15522 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKX2-8O15522 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NKX2-8O15522 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKX2-8O15522 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKX2-8O15522 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NKX2-8O15522 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms