Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARPC1BO15143 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARPC1BO15143 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARPC1BO15143 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARPC1BO15143 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ARPC1BO15143 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARPC1BO15143 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARPC1BO15143 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARPC1BO15143 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARPC1BO15143 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARPC1BO15143 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARPC1BO15143 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARPC1BO15143 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARPC1BO15143 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARPC1BO15143 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARPC1BO15143 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARPC1BO15143 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARPC1BO15143 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARPC1BO15143 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARPC1BO15143 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARPC1BO15143 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ARPC1BO15143 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ARPC1BO15143 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARPC1BO15143 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARPC1BO15143 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARPC1BO15143 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARPC1BO15143 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARPC1BO15143 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARPC1BO15143 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARPC1BO15143 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARPC1BO15143 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARPC1BO15143 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARPC1BO15143 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARPC1BO15143 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARPC1BO15143 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARPC1BO15143 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARPC1BO15143 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARPC1BO15143 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARPC1BO15143 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARPC1BO15143 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ARPC1BO15143 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARPC1BO15143 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARPC1BO15143 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARPC1BO15143 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARPC1BO15143 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARPC1BO15143 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARPC1BO15143 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARPC1BO15143 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARPC1BO15143 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARPC1BO15143 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARPC1BO15143 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARPC1BO15143 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARPC1BO15143 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARPC1BO15143 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARPC1BO15143 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARPC1BO15143 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARPC1BO15143 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARPC1BO15143 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARPC1BO15143 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARPC1BO15143 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARPC1BO15143 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARPC1BO15143 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARPC1BO15143 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ARPC1BO15143 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARPC1BO15143 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARPC1BO15143 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARPC1BO15143 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARPC1BO15143 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARPC1BO15143 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARPC1BO15143 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARPC1BO15143 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARPC1BO15143 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARPC1BO15143 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARPC1BO15143 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARPC1BO15143 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARPC1BO15143 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARPC1BO15143 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ARPC1BO15143 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ARPC1BO15143 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARPC1BO15143 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARPC1BO15143 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARPC1BO15143 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARPC1BO15143 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARPC1BO15143 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ARPC1BO15143 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARPC1BO15143 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARPC1BO15143 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARPC1BO15143 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARPC1BO15143 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARPC1BO15143 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARPC1BO15143 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARPC1BO15143 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARPC1BO15143 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ARPC1BO15143 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARPC1BO15143 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARPC1BO15143 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARPC1BO15143 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARPC1BO15143 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARPC1BO15143 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARPC1BO15143 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms