Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNPHO15079 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNPHO15079 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SNPHO15079 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNPHO15079 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNPHO15079 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNPHO15079 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNPHO15079 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNPHO15079 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNPHO15079 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNPHO15079 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNPHO15079 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNPHO15079 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNPHO15079 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNPHO15079 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNPHO15079 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNPHO15079 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNPHO15079 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNPHO15079 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNPHO15079 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNPHO15079 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNPHO15079 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNPHO15079 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNPHO15079 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNPHO15079 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNPHO15079 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNPHO15079 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SNPHO15079 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNPHO15079 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNPHO15079 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNPHO15079 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNPHO15079 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNPHO15079 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNPHO15079 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNPHO15079 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNPHO15079 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNPHO15079 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNPHO15079 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNPHO15079 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNPHO15079 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNPHO15079 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNPHO15079 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNPHO15079 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNPHO15079 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SNPHO15079 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNPHO15079 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNPHO15079 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNPHO15079 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNPHO15079 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNPHO15079 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNPHO15079 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNPHO15079 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNPHO15079 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNPHO15079 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNPHO15079 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNPHO15079 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNPHO15079 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNPHO15079 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNPHO15079 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNPHO15079 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNPHO15079 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNPHO15079 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNPHO15079 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNPHO15079 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNPHO15079 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNPHO15079 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNPHO15079 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNPHO15079 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNPHO15079 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNPHO15079 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNPHO15079 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNPHO15079 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNPHO15079 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNPHO15079 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SNPHO15079 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNPHO15079 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNPHO15079 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNPHO15079 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNPHO15079 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNPHO15079 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNPHO15079 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNPHO15079 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNPHO15079 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNPHO15079 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNPHO15079 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNPHO15079 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNPHO15079 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNPHO15079 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNPHO15079 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNPHO15079 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNPHO15079 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNPHO15079 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNPHO15079 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SNPHO15079 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNPHO15079 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNPHO15079 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNPHO15079 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNPHO15079 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNPHO15079 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNPHO15079 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms