Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
PTPRTO14522 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
PTPRTO14522 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
PTPRTO14522 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
PTPRTO14522 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
PTPRTO14522 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PTPRTO14522 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
PTPRTO14522 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
PTPRTO14522 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
PTPRTO14522 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
PTPRTO14522 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PTPRTO14522 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PTPRTO14522 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
PTPRTO14522 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
PTPRTO14522 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
PTPRTO14522 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
PTPRTO14522 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
PTPRTO14522 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
PTPRTO14522 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
PTPRTO14522 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
PTPRTO14522 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
PTPRTO14522 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
PTPRTO14522 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
PTPRTO14522 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
PTPRTO14522 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
PTPRTO14522 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PTPRTO14522 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PTPRTO14522 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PTPRTO14522 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PTPRTO14522 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PTPRTO14522 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PTPRTO14522 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PTPRTO14522 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PTPRTO14522 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
PTPRTO14522 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
PTPRTO14522 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
PTPRTO14522 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
PTPRTO14522 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
PTPRTO14522 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
PTPRTO14522 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
PTPRTO14522 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
PTPRTO14522 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
PTPRTO14522 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
PTPRTO14522 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
PTPRTO14522 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
PTPRTO14522 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
PTPRTO14522 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
PTPRTO14522 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PTPRTO14522 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
PTPRTO14522 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PTPRTO14522 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PTPRTO14522 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PTPRTO14522 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
PTPRTO14522 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PTPRTO14522 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PTPRTO14522 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
PTPRTO14522 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
PTPRTO14522 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PTPRTO14522 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PTPRTO14522 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC36.93■■■■□ 3.5
PTPRTO14522 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PTPRTO14522 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
PTPRTO14522 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
PTPRTO14522 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC36.93■■■■□ 3.5
PTPRTO14522 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PTPRTO14522 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PTPRTO14522 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
PTPRTO14522 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
PTPRTO14522 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
PTPRTO14522 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
PTPRTO14522 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
PTPRTO14522 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
PTPRTO14522 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
PTPRTO14522 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
PTPRTO14522 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
PTPRTO14522 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
PTPRTO14522 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
PTPRTO14522 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
PTPRTO14522 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
PTPRTO14522 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
PTPRTO14522 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
PTPRTO14522 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
PTPRTO14522 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
PTPRTO14522 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
PTPRTO14522 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
PTPRTO14522 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PTPRTO14522 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PTPRTO14522 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PTPRTO14522 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PTPRTO14522 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PTPRTO14522 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
PTPRTO14522 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC36.86■■■■□ 3.49
PTPRTO14522 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PTPRTO14522 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PTPRTO14522 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PTPRTO14522 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PTPRTO14522 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PTPRTO14522 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PTPRTO14522 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
PTPRTO14522 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms