Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
E2F3O00716 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
E2F3O00716 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
E2F3O00716 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
E2F3O00716 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
E2F3O00716 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
E2F3O00716 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
E2F3O00716 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
E2F3O00716 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
E2F3O00716 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
E2F3O00716 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
E2F3O00716 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
E2F3O00716 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
E2F3O00716 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
E2F3O00716 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
E2F3O00716 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
E2F3O00716 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
E2F3O00716 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
E2F3O00716 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
E2F3O00716 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
E2F3O00716 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
E2F3O00716 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
E2F3O00716 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
E2F3O00716 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
E2F3O00716 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
E2F3O00716 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
E2F3O00716 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E2F3O00716 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
E2F3O00716 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E2F3O00716 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E2F3O00716 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E2F3O00716 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
E2F3O00716 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
E2F3O00716 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
E2F3O00716 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
E2F3O00716 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
E2F3O00716 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
E2F3O00716 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
E2F3O00716 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
E2F3O00716 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
E2F3O00716 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
E2F3O00716 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
E2F3O00716 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
E2F3O00716 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
E2F3O00716 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
E2F3O00716 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
E2F3O00716 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
E2F3O00716 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
E2F3O00716 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
E2F3O00716 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
E2F3O00716 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
E2F3O00716 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
E2F3O00716 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
E2F3O00716 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
E2F3O00716 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
E2F3O00716 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
E2F3O00716 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
E2F3O00716 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
E2F3O00716 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E2F3O00716 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E2F3O00716 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
E2F3O00716 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
E2F3O00716 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
E2F3O00716 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
E2F3O00716 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
E2F3O00716 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
E2F3O00716 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
E2F3O00716 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
E2F3O00716 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
E2F3O00716 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
E2F3O00716 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
E2F3O00716 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
E2F3O00716 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
E2F3O00716 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E2F3O00716 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E2F3O00716 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
E2F3O00716 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
E2F3O00716 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E2F3O00716 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
E2F3O00716 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
E2F3O00716 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
E2F3O00716 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
E2F3O00716 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
E2F3O00716 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
E2F3O00716 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
E2F3O00716 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
E2F3O00716 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
E2F3O00716 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
E2F3O00716 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
E2F3O00716 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
E2F3O00716 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
E2F3O00716 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
E2F3O00716 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
E2F3O00716 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
E2F3O00716 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
E2F3O00716 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
E2F3O00716 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
E2F3O00716 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
E2F3O00716 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
E2F3O00716 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms