Protein–RNA interactions for Protein: O00635

TRIM38, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM38, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM38O00635 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM38O00635 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM38O00635 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM38O00635 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM38O00635 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM38O00635 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM38O00635 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM38O00635 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM38O00635 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM38O00635 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM38O00635 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM38O00635 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM38O00635 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM38O00635 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM38O00635 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM38O00635 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM38O00635 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM38O00635 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM38O00635 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM38O00635 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM38O00635 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM38O00635 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM38O00635 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM38O00635 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM38O00635 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM38O00635 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM38O00635 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM38O00635 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM38O00635 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM38O00635 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM38O00635 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM38O00635 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM38O00635 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM38O00635 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM38O00635 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM38O00635 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM38O00635 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM38O00635 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM38O00635 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM38O00635 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM38O00635 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM38O00635 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM38O00635 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM38O00635 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM38O00635 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM38O00635 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM38O00635 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM38O00635 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM38O00635 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM38O00635 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM38O00635 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM38O00635 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM38O00635 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM38O00635 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM38O00635 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM38O00635 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM38O00635 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM38O00635 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM38O00635 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM38O00635 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM38O00635 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM38O00635 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM38O00635 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM38O00635 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM38O00635 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM38O00635 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM38O00635 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM38O00635 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM38O00635 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM38O00635 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM38O00635 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM38O00635 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM38O00635 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM38O00635 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM38O00635 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM38O00635 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRIM38O00635 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRIM38O00635 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM38O00635 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM38O00635 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM38O00635 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM38O00635 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM38O00635 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM38O00635 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM38O00635 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM38O00635 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM38O00635 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM38O00635 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM38O00635 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM38O00635 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM38O00635 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM38O00635 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM38O00635 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM38O00635 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM38O00635 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM38O00635 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM38O00635 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM38O00635 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM38O00635 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM38O00635 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms