Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EBAG9O00559 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EBAG9O00559 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EBAG9O00559 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EBAG9O00559 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EBAG9O00559 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EBAG9O00559 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EBAG9O00559 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EBAG9O00559 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EBAG9O00559 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EBAG9O00559 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EBAG9O00559 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EBAG9O00559 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EBAG9O00559 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EBAG9O00559 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EBAG9O00559 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EBAG9O00559 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EBAG9O00559 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EBAG9O00559 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EBAG9O00559 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EBAG9O00559 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EBAG9O00559 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EBAG9O00559 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EBAG9O00559 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EBAG9O00559 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EBAG9O00559 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EBAG9O00559 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
EBAG9O00559 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EBAG9O00559 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EBAG9O00559 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EBAG9O00559 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EBAG9O00559 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EBAG9O00559 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EBAG9O00559 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EBAG9O00559 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EBAG9O00559 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EBAG9O00559 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EBAG9O00559 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EBAG9O00559 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EBAG9O00559 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EBAG9O00559 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EBAG9O00559 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EBAG9O00559 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EBAG9O00559 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
EBAG9O00559 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EBAG9O00559 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EBAG9O00559 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EBAG9O00559 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EBAG9O00559 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EBAG9O00559 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EBAG9O00559 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EBAG9O00559 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EBAG9O00559 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EBAG9O00559 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EBAG9O00559 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EBAG9O00559 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EBAG9O00559 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EBAG9O00559 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EBAG9O00559 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EBAG9O00559 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EBAG9O00559 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EBAG9O00559 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EBAG9O00559 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EBAG9O00559 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EBAG9O00559 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EBAG9O00559 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EBAG9O00559 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EBAG9O00559 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EBAG9O00559 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EBAG9O00559 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EBAG9O00559 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EBAG9O00559 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EBAG9O00559 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EBAG9O00559 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EBAG9O00559 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EBAG9O00559 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EBAG9O00559 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EBAG9O00559 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EBAG9O00559 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EBAG9O00559 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EBAG9O00559 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EBAG9O00559 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EBAG9O00559 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EBAG9O00559 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EBAG9O00559 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
EBAG9O00559 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EBAG9O00559 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EBAG9O00559 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EBAG9O00559 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EBAG9O00559 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EBAG9O00559 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EBAG9O00559 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EBAG9O00559 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EBAG9O00559 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EBAG9O00559 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EBAG9O00559 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EBAG9O00559 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EBAG9O00559 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EBAG9O00559 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EBAG9O00559 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms