Protein–RNA interactions for Protein: O00399

DCTN6, Dynactin subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN6O00399 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCTN6O00399 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCTN6O00399 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCTN6O00399 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCTN6O00399 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCTN6O00399 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCTN6O00399 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCTN6O00399 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DCTN6O00399 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCTN6O00399 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCTN6O00399 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCTN6O00399 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCTN6O00399 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCTN6O00399 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCTN6O00399 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCTN6O00399 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCTN6O00399 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCTN6O00399 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCTN6O00399 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCTN6O00399 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCTN6O00399 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCTN6O00399 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCTN6O00399 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCTN6O00399 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCTN6O00399 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCTN6O00399 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCTN6O00399 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCTN6O00399 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCTN6O00399 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCTN6O00399 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCTN6O00399 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCTN6O00399 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCTN6O00399 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCTN6O00399 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCTN6O00399 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCTN6O00399 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCTN6O00399 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCTN6O00399 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCTN6O00399 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCTN6O00399 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCTN6O00399 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCTN6O00399 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DCTN6O00399 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCTN6O00399 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCTN6O00399 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCTN6O00399 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCTN6O00399 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCTN6O00399 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCTN6O00399 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCTN6O00399 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DCTN6O00399 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCTN6O00399 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCTN6O00399 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCTN6O00399 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCTN6O00399 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCTN6O00399 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCTN6O00399 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DCTN6O00399 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DCTN6O00399 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCTN6O00399 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCTN6O00399 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCTN6O00399 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCTN6O00399 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCTN6O00399 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCTN6O00399 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCTN6O00399 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCTN6O00399 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DCTN6O00399 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCTN6O00399 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DCTN6O00399 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCTN6O00399 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCTN6O00399 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCTN6O00399 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCTN6O00399 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCTN6O00399 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCTN6O00399 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCTN6O00399 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCTN6O00399 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCTN6O00399 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCTN6O00399 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCTN6O00399 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCTN6O00399 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCTN6O00399 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCTN6O00399 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCTN6O00399 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
DCTN6O00399 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCTN6O00399 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DCTN6O00399 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DCTN6O00399 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DCTN6O00399 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DCTN6O00399 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DCTN6O00399 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DCTN6O00399 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DCTN6O00399 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DCTN6O00399 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DCTN6O00399 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCTN6O00399 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCTN6O00399 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCTN6O00399 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCTN6O00399 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms