Protein–RNA interactions for Protein: O00341

SLC1A7, Excitatory amino acid transporter 5, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A7O00341 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC1A7O00341 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC1A7O00341 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC1A7O00341 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC1A7O00341 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC1A7O00341 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A7O00341 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A7O00341 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A7O00341 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A7O00341 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A7O00341 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A7O00341 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A7O00341 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A7O00341 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A7O00341 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A7O00341 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A7O00341 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A7O00341 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A7O00341 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A7O00341 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A7O00341 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A7O00341 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A7O00341 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A7O00341 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A7O00341 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A7O00341 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A7O00341 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A7O00341 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A7O00341 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A7O00341 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A7O00341 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A7O00341 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A7O00341 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A7O00341 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A7O00341 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A7O00341 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A7O00341 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A7O00341 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC1A7O00341 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC1A7O00341 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC1A7O00341 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC1A7O00341 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC1A7O00341 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC1A7O00341 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC1A7O00341 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC1A7O00341 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A7O00341 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A7O00341 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A7O00341 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A7O00341 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A7O00341 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A7O00341 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC1A7O00341 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC1A7O00341 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC1A7O00341 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC1A7O00341 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC1A7O00341 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC1A7O00341 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC1A7O00341 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC1A7O00341 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC1A7O00341 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC1A7O00341 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC1A7O00341 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC1A7O00341 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC1A7O00341 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC1A7O00341 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC1A7O00341 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC1A7O00341 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC1A7O00341 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC1A7O00341 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC1A7O00341 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC1A7O00341 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC1A7O00341 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC1A7O00341 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC1A7O00341 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC1A7O00341 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC1A7O00341 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC1A7O00341 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC1A7O00341 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC1A7O00341 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC1A7O00341 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC1A7O00341 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC1A7O00341 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC1A7O00341 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC1A7O00341 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC1A7O00341 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC1A7O00341 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC1A7O00341 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC1A7O00341 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC1A7O00341 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC1A7O00341 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC1A7O00341 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC1A7O00341 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC1A7O00341 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A7O00341 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A7O00341 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A7O00341 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A7O00341 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A7O00341 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC1A7O00341 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms