Protein–RNA interactions for Protein: O00220

TNFRSF10A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10A, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10AO00220 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNFRSF10AO00220 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNFRSF10AO00220 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNFRSF10AO00220 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TNFRSF10AO00220 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFRSF10AO00220 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFRSF10AO00220 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFRSF10AO00220 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFRSF10AO00220 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFRSF10AO00220 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFRSF10AO00220 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFRSF10AO00220 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFRSF10AO00220 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFRSF10AO00220 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNFRSF10AO00220 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNFRSF10AO00220 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFRSF10AO00220 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFRSF10AO00220 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFRSF10AO00220 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFRSF10AO00220 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFRSF10AO00220 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNFRSF10AO00220 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNFRSF10AO00220 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNFRSF10AO00220 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
TNFRSF10AO00220 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFRSF10AO00220 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFRSF10AO00220 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFRSF10AO00220 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNFRSF10AO00220 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNFRSF10AO00220 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNFRSF10AO00220 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNFRSF10AO00220 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFRSF10AO00220 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFRSF10AO00220 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNFRSF10AO00220 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFRSF10AO00220 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFRSF10AO00220 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFRSF10AO00220 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNFRSF10AO00220 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNFRSF10AO00220 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNFRSF10AO00220 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TNFRSF10AO00220 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNFRSF10AO00220 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TNFRSF10AO00220 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
TNFRSF10AO00220 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNFRSF10AO00220 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNFRSF10AO00220 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNFRSF10AO00220 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNFRSF10AO00220 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TNFRSF10AO00220 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNFRSF10AO00220 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNFRSF10AO00220 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNFRSF10AO00220 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFRSF10AO00220 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFRSF10AO00220 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFRSF10AO00220 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFRSF10AO00220 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFRSF10AO00220 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFRSF10AO00220 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFRSF10AO00220 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFRSF10AO00220 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFRSF10AO00220 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFRSF10AO00220 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFRSF10AO00220 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFRSF10AO00220 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFRSF10AO00220 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFRSF10AO00220 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFRSF10AO00220 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFRSF10AO00220 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFRSF10AO00220 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFRSF10AO00220 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFRSF10AO00220 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFRSF10AO00220 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFRSF10AO00220 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFRSF10AO00220 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFRSF10AO00220 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFRSF10AO00220 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFRSF10AO00220 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFRSF10AO00220 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFRSF10AO00220 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFRSF10AO00220 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFRSF10AO00220 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNFRSF10AO00220 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNFRSF10AO00220 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TNFRSF10AO00220 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TNFRSF10AO00220 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNFRSF10AO00220 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TNFRSF10AO00220 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TNFRSF10AO00220 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TNFRSF10AO00220 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFRSF10AO00220 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNFRSF10AO00220 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNFRSF10AO00220 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TNFRSF10AO00220 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TNFRSF10AO00220 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNFRSF10AO00220 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNFRSF10AO00220 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNFRSF10AO00220 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TNFRSF10AO00220 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNFRSF10AO00220 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms