Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APOC4-APOC2K7ER74 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOC4-APOC2K7ER74 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOC4-APOC2K7ER74 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOC4-APOC2K7ER74 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOC4-APOC2K7ER74 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
APOC4-APOC2K7ER74 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
APOC4-APOC2K7ER74 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
APOC4-APOC2K7ER74 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
APOC4-APOC2K7ER74 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
APOC4-APOC2K7ER74 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
APOC4-APOC2K7ER74 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
APOC4-APOC2K7ER74 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
APOC4-APOC2K7ER74 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
APOC4-APOC2K7ER74 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
APOC4-APOC2K7ER74 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
APOC4-APOC2K7ER74 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOC4-APOC2K7ER74 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOC4-APOC2K7ER74 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOC4-APOC2K7ER74 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOC4-APOC2K7ER74 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOC4-APOC2K7ER74 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOC4-APOC2K7ER74 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOC4-APOC2K7ER74 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOC4-APOC2K7ER74 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
APOC4-APOC2K7ER74 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
APOC4-APOC2K7ER74 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APOC4-APOC2K7ER74 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APOC4-APOC2K7ER74 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOC4-APOC2K7ER74 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOC4-APOC2K7ER74 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
APOC4-APOC2K7ER74 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
APOC4-APOC2K7ER74 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
APOC4-APOC2K7ER74 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
APOC4-APOC2K7ER74 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
APOC4-APOC2K7ER74 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
APOC4-APOC2K7ER74 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
APOC4-APOC2K7ER74 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
APOC4-APOC2K7ER74 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
APOC4-APOC2K7ER74 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOC4-APOC2K7ER74 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
APOC4-APOC2K7ER74 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
APOC4-APOC2K7ER74 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
APOC4-APOC2K7ER74 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
APOC4-APOC2K7ER74 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOC4-APOC2K7ER74 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOC4-APOC2K7ER74 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOC4-APOC2K7ER74 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOC4-APOC2K7ER74 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOC4-APOC2K7ER74 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APOC4-APOC2K7ER74 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
APOC4-APOC2K7ER74 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APOC4-APOC2K7ER74 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
APOC4-APOC2K7ER74 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
APOC4-APOC2K7ER74 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
APOC4-APOC2K7ER74 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
APOC4-APOC2K7ER74 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
APOC4-APOC2K7ER74 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
APOC4-APOC2K7ER74 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
APOC4-APOC2K7ER74 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
APOC4-APOC2K7ER74 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
APOC4-APOC2K7ER74 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
APOC4-APOC2K7ER74 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
APOC4-APOC2K7ER74 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APOC4-APOC2K7ER74 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
APOC4-APOC2K7ER74 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APOC4-APOC2K7ER74 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
APOC4-APOC2K7ER74 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOC4-APOC2K7ER74 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOC4-APOC2K7ER74 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOC4-APOC2K7ER74 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOC4-APOC2K7ER74 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOC4-APOC2K7ER74 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOC4-APOC2K7ER74 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOC4-APOC2K7ER74 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOC4-APOC2K7ER74 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APOC4-APOC2K7ER74 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
APOC4-APOC2K7ER74 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APOC4-APOC2K7ER74 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APOC4-APOC2K7ER74 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
APOC4-APOC2K7ER74 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
APOC4-APOC2K7ER74 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
APOC4-APOC2K7ER74 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
APOC4-APOC2K7ER74 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
APOC4-APOC2K7ER74 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
APOC4-APOC2K7ER74 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APOC4-APOC2K7ER74 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOC4-APOC2K7ER74 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOC4-APOC2K7ER74 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOC4-APOC2K7ER74 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOC4-APOC2K7ER74 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APOC4-APOC2K7ER74 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms