Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms