Protein–RNA interactions for Protein: F8VP50

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VP50 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
F8VP50 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
F8VP50 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
F8VP50 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
F8VP50 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
F8VP50 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
F8VP50 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
F8VP50 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
F8VP50 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
F8VP50 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
F8VP50 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
F8VP50 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
F8VP50 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
F8VP50 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
F8VP50 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
F8VP50 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
F8VP50 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
F8VP50 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
F8VP50 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
F8VP50 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
F8VP50 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
F8VP50 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
F8VP50 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
F8VP50 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
F8VP50 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
F8VP50 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
F8VP50 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
F8VP50 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
F8VP50 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
F8VP50 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
F8VP50 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
F8VP50 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
F8VP50 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
F8VP50 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
F8VP50 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
F8VP50 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
F8VP50 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
F8VP50 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
F8VP50 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
F8VP50 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
F8VP50 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
F8VP50 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
F8VP50 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
F8VP50 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
F8VP50 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
F8VP50 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
F8VP50 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
F8VP50 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
F8VP50 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
F8VP50 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
F8VP50 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
F8VP50 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
F8VP50 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
F8VP50 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
F8VP50 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
F8VP50 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
F8VP50 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
F8VP50 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
F8VP50 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
F8VP50 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
F8VP50 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
F8VP50 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
F8VP50 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
F8VP50 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
F8VP50 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
F8VP50 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
F8VP50 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
F8VP50 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
F8VP50 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
F8VP50 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
F8VP50 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
F8VP50 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
F8VP50 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
F8VP50 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
F8VP50 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
F8VP50 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
F8VP50 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
F8VP50 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
F8VP50 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
F8VP50 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
F8VP50 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
F8VP50 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
F8VP50 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
F8VP50 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
F8VP50 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
F8VP50 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
F8VP50 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
F8VP50 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
F8VP50 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
F8VP50 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
F8VP50 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
F8VP50 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
F8VP50 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
F8VP50 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
F8VP50 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
F8VP50 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
F8VP50 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
F8VP50 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
F8VP50 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
F8VP50 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms