Protein–RNA interactions for Protein: F5H4B4

FAM227A, Protein FAM227A, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227AF5H4B4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM227AF5H4B4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM227AF5H4B4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM227AF5H4B4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM227AF5H4B4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM227AF5H4B4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM227AF5H4B4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM227AF5H4B4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM227AF5H4B4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM227AF5H4B4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM227AF5H4B4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM227AF5H4B4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM227AF5H4B4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM227AF5H4B4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM227AF5H4B4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM227AF5H4B4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM227AF5H4B4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM227AF5H4B4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM227AF5H4B4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM227AF5H4B4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM227AF5H4B4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM227AF5H4B4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM227AF5H4B4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM227AF5H4B4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM227AF5H4B4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM227AF5H4B4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM227AF5H4B4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM227AF5H4B4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM227AF5H4B4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM227AF5H4B4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM227AF5H4B4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM227AF5H4B4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM227AF5H4B4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM227AF5H4B4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM227AF5H4B4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM227AF5H4B4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM227AF5H4B4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM227AF5H4B4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM227AF5H4B4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM227AF5H4B4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM227AF5H4B4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM227AF5H4B4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM227AF5H4B4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM227AF5H4B4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM227AF5H4B4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM227AF5H4B4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM227AF5H4B4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM227AF5H4B4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM227AF5H4B4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM227AF5H4B4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM227AF5H4B4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM227AF5H4B4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM227AF5H4B4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM227AF5H4B4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM227AF5H4B4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM227AF5H4B4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM227AF5H4B4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM227AF5H4B4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM227AF5H4B4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM227AF5H4B4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM227AF5H4B4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM227AF5H4B4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM227AF5H4B4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM227AF5H4B4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM227AF5H4B4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM227AF5H4B4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM227AF5H4B4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM227AF5H4B4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM227AF5H4B4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM227AF5H4B4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM227AF5H4B4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM227AF5H4B4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM227AF5H4B4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM227AF5H4B4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM227AF5H4B4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM227AF5H4B4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM227AF5H4B4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM227AF5H4B4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM227AF5H4B4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM227AF5H4B4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM227AF5H4B4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM227AF5H4B4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM227AF5H4B4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM227AF5H4B4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM227AF5H4B4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM227AF5H4B4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FAM227AF5H4B4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM227AF5H4B4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM227AF5H4B4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM227AF5H4B4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM227AF5H4B4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM227AF5H4B4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM227AF5H4B4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM227AF5H4B4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM227AF5H4B4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM227AF5H4B4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM227AF5H4B4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM227AF5H4B4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM227AF5H4B4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM227AF5H4B4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms