Protein–RNA interactions for Protein: B4DS77

SHISA9, Protein shisa-9, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA9B4DS77 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHISA9B4DS77 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHISA9B4DS77 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHISA9B4DS77 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHISA9B4DS77 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHISA9B4DS77 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SHISA9B4DS77 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHISA9B4DS77 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHISA9B4DS77 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHISA9B4DS77 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHISA9B4DS77 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHISA9B4DS77 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHISA9B4DS77 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHISA9B4DS77 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHISA9B4DS77 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHISA9B4DS77 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHISA9B4DS77 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHISA9B4DS77 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHISA9B4DS77 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHISA9B4DS77 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHISA9B4DS77 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHISA9B4DS77 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SHISA9B4DS77 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHISA9B4DS77 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHISA9B4DS77 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHISA9B4DS77 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHISA9B4DS77 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SHISA9B4DS77 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHISA9B4DS77 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHISA9B4DS77 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHISA9B4DS77 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHISA9B4DS77 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHISA9B4DS77 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHISA9B4DS77 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHISA9B4DS77 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHISA9B4DS77 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHISA9B4DS77 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SHISA9B4DS77 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHISA9B4DS77 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHISA9B4DS77 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHISA9B4DS77 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SHISA9B4DS77 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHISA9B4DS77 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHISA9B4DS77 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHISA9B4DS77 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHISA9B4DS77 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHISA9B4DS77 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHISA9B4DS77 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHISA9B4DS77 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHISA9B4DS77 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHISA9B4DS77 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SHISA9B4DS77 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHISA9B4DS77 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHISA9B4DS77 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHISA9B4DS77 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHISA9B4DS77 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SHISA9B4DS77 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHISA9B4DS77 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHISA9B4DS77 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHISA9B4DS77 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SHISA9B4DS77 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SHISA9B4DS77 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SHISA9B4DS77 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHISA9B4DS77 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHISA9B4DS77 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHISA9B4DS77 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHISA9B4DS77 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHISA9B4DS77 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHISA9B4DS77 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHISA9B4DS77 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHISA9B4DS77 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHISA9B4DS77 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHISA9B4DS77 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHISA9B4DS77 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SHISA9B4DS77 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHISA9B4DS77 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHISA9B4DS77 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHISA9B4DS77 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHISA9B4DS77 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHISA9B4DS77 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHISA9B4DS77 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHISA9B4DS77 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SHISA9B4DS77 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHISA9B4DS77 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHISA9B4DS77 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHISA9B4DS77 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHISA9B4DS77 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SHISA9B4DS77 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SHISA9B4DS77 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHISA9B4DS77 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHISA9B4DS77 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHISA9B4DS77 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SHISA9B4DS77 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHISA9B4DS77 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHISA9B4DS77 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHISA9B4DS77 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHISA9B4DS77 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHISA9B4DS77 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHISA9B4DS77 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SHISA9B4DS77 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms