Protein–RNA interactions for Protein: A6PVS8

LRRIQ3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ3A6PVS8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRIQ3A6PVS8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRIQ3A6PVS8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRIQ3A6PVS8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRIQ3A6PVS8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRIQ3A6PVS8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRIQ3A6PVS8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRIQ3A6PVS8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRIQ3A6PVS8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRIQ3A6PVS8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRIQ3A6PVS8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
LRRIQ3A6PVS8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRIQ3A6PVS8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRIQ3A6PVS8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRIQ3A6PVS8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRIQ3A6PVS8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRIQ3A6PVS8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRIQ3A6PVS8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRIQ3A6PVS8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRIQ3A6PVS8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRIQ3A6PVS8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRIQ3A6PVS8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRIQ3A6PVS8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRIQ3A6PVS8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRIQ3A6PVS8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRIQ3A6PVS8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRIQ3A6PVS8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRIQ3A6PVS8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRIQ3A6PVS8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRIQ3A6PVS8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRIQ3A6PVS8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRIQ3A6PVS8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRIQ3A6PVS8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRIQ3A6PVS8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRIQ3A6PVS8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRIQ3A6PVS8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRIQ3A6PVS8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRIQ3A6PVS8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRIQ3A6PVS8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRIQ3A6PVS8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRIQ3A6PVS8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRIQ3A6PVS8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRIQ3A6PVS8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRIQ3A6PVS8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRIQ3A6PVS8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRIQ3A6PVS8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRIQ3A6PVS8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRIQ3A6PVS8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRIQ3A6PVS8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRIQ3A6PVS8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRIQ3A6PVS8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRIQ3A6PVS8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRIQ3A6PVS8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRIQ3A6PVS8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRIQ3A6PVS8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRIQ3A6PVS8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRIQ3A6PVS8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRIQ3A6PVS8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRIQ3A6PVS8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRIQ3A6PVS8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRIQ3A6PVS8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRIQ3A6PVS8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRIQ3A6PVS8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRIQ3A6PVS8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRIQ3A6PVS8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRIQ3A6PVS8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRIQ3A6PVS8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRIQ3A6PVS8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRIQ3A6PVS8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRIQ3A6PVS8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRIQ3A6PVS8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRIQ3A6PVS8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRIQ3A6PVS8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRIQ3A6PVS8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRIQ3A6PVS8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRIQ3A6PVS8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRIQ3A6PVS8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRIQ3A6PVS8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRIQ3A6PVS8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRIQ3A6PVS8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRIQ3A6PVS8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRIQ3A6PVS8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRIQ3A6PVS8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRIQ3A6PVS8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRIQ3A6PVS8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRIQ3A6PVS8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRIQ3A6PVS8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRIQ3A6PVS8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRIQ3A6PVS8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRIQ3A6PVS8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRIQ3A6PVS8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRIQ3A6PVS8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRIQ3A6PVS8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRIQ3A6PVS8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRIQ3A6PVS8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRIQ3A6PVS8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRIQ3A6PVS8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRIQ3A6PVS8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRIQ3A6PVS8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRIQ3A6PVS8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms