Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KNCNA6PVL3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KNCNA6PVL3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KNCNA6PVL3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KNCNA6PVL3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KNCNA6PVL3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KNCNA6PVL3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KNCNA6PVL3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KNCNA6PVL3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KNCNA6PVL3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KNCNA6PVL3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KNCNA6PVL3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KNCNA6PVL3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KNCNA6PVL3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KNCNA6PVL3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KNCNA6PVL3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KNCNA6PVL3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KNCNA6PVL3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KNCNA6PVL3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KNCNA6PVL3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KNCNA6PVL3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KNCNA6PVL3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KNCNA6PVL3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KNCNA6PVL3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KNCNA6PVL3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KNCNA6PVL3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KNCNA6PVL3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KNCNA6PVL3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KNCNA6PVL3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KNCNA6PVL3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KNCNA6PVL3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KNCNA6PVL3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KNCNA6PVL3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KNCNA6PVL3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KNCNA6PVL3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KNCNA6PVL3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KNCNA6PVL3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KNCNA6PVL3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KNCNA6PVL3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KNCNA6PVL3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KNCNA6PVL3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KNCNA6PVL3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KNCNA6PVL3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KNCNA6PVL3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KNCNA6PVL3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KNCNA6PVL3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KNCNA6PVL3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KNCNA6PVL3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KNCNA6PVL3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KNCNA6PVL3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KNCNA6PVL3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KNCNA6PVL3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KNCNA6PVL3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KNCNA6PVL3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KNCNA6PVL3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KNCNA6PVL3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KNCNA6PVL3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KNCNA6PVL3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KNCNA6PVL3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KNCNA6PVL3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KNCNA6PVL3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KNCNA6PVL3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KNCNA6PVL3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KNCNA6PVL3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KNCNA6PVL3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KNCNA6PVL3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KNCNA6PVL3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KNCNA6PVL3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KNCNA6PVL3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KNCNA6PVL3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KNCNA6PVL3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KNCNA6PVL3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KNCNA6PVL3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KNCNA6PVL3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KNCNA6PVL3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KNCNA6PVL3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KNCNA6PVL3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KNCNA6PVL3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KNCNA6PVL3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KNCNA6PVL3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KNCNA6PVL3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KNCNA6PVL3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KNCNA6PVL3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KNCNA6PVL3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KNCNA6PVL3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KNCNA6PVL3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KNCNA6PVL3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KNCNA6PVL3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KNCNA6PVL3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KNCNA6PVL3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KNCNA6PVL3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KNCNA6PVL3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
KNCNA6PVL3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
KNCNA6PVL3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
KNCNA6PVL3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
KNCNA6PVL3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KNCNA6PVL3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KNCNA6PVL3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KNCNA6PVL3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KNCNA6PVL3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms