Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW4

LRRC3C, Leucine-rich repeat-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3CA6NJW4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC3CA6NJW4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC3CA6NJW4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC3CA6NJW4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC3CA6NJW4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC3CA6NJW4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC3CA6NJW4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC3CA6NJW4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC3CA6NJW4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC3CA6NJW4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC3CA6NJW4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC3CA6NJW4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC3CA6NJW4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC3CA6NJW4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC3CA6NJW4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC3CA6NJW4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC3CA6NJW4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC3CA6NJW4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC3CA6NJW4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC3CA6NJW4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC3CA6NJW4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC3CA6NJW4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC3CA6NJW4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC3CA6NJW4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC3CA6NJW4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC3CA6NJW4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC3CA6NJW4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC3CA6NJW4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC3CA6NJW4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC3CA6NJW4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC3CA6NJW4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC3CA6NJW4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC3CA6NJW4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC3CA6NJW4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC3CA6NJW4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC3CA6NJW4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC3CA6NJW4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC3CA6NJW4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC3CA6NJW4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC3CA6NJW4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC3CA6NJW4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC3CA6NJW4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC3CA6NJW4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC3CA6NJW4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC3CA6NJW4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC3CA6NJW4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC3CA6NJW4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC3CA6NJW4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC3CA6NJW4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC3CA6NJW4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC3CA6NJW4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC3CA6NJW4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC3CA6NJW4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC3CA6NJW4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC3CA6NJW4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC3CA6NJW4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC3CA6NJW4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC3CA6NJW4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC3CA6NJW4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC3CA6NJW4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC3CA6NJW4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC3CA6NJW4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC3CA6NJW4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC3CA6NJW4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC3CA6NJW4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC3CA6NJW4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC3CA6NJW4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC3CA6NJW4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC3CA6NJW4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC3CA6NJW4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC3CA6NJW4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC3CA6NJW4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC3CA6NJW4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC3CA6NJW4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC3CA6NJW4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC3CA6NJW4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC3CA6NJW4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC3CA6NJW4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC3CA6NJW4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRC3CA6NJW4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRC3CA6NJW4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC3CA6NJW4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC3CA6NJW4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC3CA6NJW4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC3CA6NJW4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC3CA6NJW4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC3CA6NJW4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC3CA6NJW4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC3CA6NJW4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC3CA6NJW4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC3CA6NJW4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC3CA6NJW4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC3CA6NJW4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC3CA6NJW4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC3CA6NJW4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC3CA6NJW4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC3CA6NJW4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC3CA6NJW4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC3CA6NJW4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC3CA6NJW4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms