Protein–RNA interactions for Protein: A6NF36

CCDC182, Coiled-coil domain-containing protein 182, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC182A6NF36 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC182A6NF36 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC182A6NF36 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC182A6NF36 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC182A6NF36 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC182A6NF36 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC182A6NF36 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC182A6NF36 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC182A6NF36 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC182A6NF36 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC182A6NF36 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC182A6NF36 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC182A6NF36 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC182A6NF36 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC182A6NF36 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC182A6NF36 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC182A6NF36 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC182A6NF36 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC182A6NF36 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC182A6NF36 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC182A6NF36 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC182A6NF36 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC182A6NF36 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC182A6NF36 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC182A6NF36 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC182A6NF36 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC182A6NF36 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC182A6NF36 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC182A6NF36 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC182A6NF36 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC182A6NF36 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC182A6NF36 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC182A6NF36 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC182A6NF36 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC182A6NF36 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC182A6NF36 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC182A6NF36 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC182A6NF36 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC182A6NF36 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC182A6NF36 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC182A6NF36 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC182A6NF36 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC182A6NF36 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC182A6NF36 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC182A6NF36 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC182A6NF36 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC182A6NF36 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC182A6NF36 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC182A6NF36 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC182A6NF36 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC182A6NF36 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC182A6NF36 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC182A6NF36 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC182A6NF36 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC182A6NF36 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC182A6NF36 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC182A6NF36 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC182A6NF36 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC182A6NF36 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC182A6NF36 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC182A6NF36 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC182A6NF36 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC182A6NF36 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC182A6NF36 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC182A6NF36 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC182A6NF36 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC182A6NF36 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC182A6NF36 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC182A6NF36 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC182A6NF36 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC182A6NF36 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC182A6NF36 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC182A6NF36 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC182A6NF36 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC182A6NF36 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC182A6NF36 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC182A6NF36 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC182A6NF36 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC182A6NF36 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC182A6NF36 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC182A6NF36 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC182A6NF36 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC182A6NF36 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC182A6NF36 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC182A6NF36 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC182A6NF36 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC182A6NF36 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC182A6NF36 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC182A6NF36 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC182A6NF36 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC182A6NF36 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC182A6NF36 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC182A6NF36 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC182A6NF36 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC182A6NF36 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC182A6NF36 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC182A6NF36 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC182A6NF36 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC182A6NF36 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC182A6NF36 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms