Protein–RNA interactions for Protein: A6NDY0

PABPN1L, Embryonic polyadenylate-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPN1LA6NDY0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PABPN1LA6NDY0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PABPN1LA6NDY0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PABPN1LA6NDY0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PABPN1LA6NDY0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PABPN1LA6NDY0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PABPN1LA6NDY0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PABPN1LA6NDY0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PABPN1LA6NDY0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PABPN1LA6NDY0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PABPN1LA6NDY0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PABPN1LA6NDY0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PABPN1LA6NDY0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PABPN1LA6NDY0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PABPN1LA6NDY0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PABPN1LA6NDY0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PABPN1LA6NDY0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PABPN1LA6NDY0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PABPN1LA6NDY0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PABPN1LA6NDY0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PABPN1LA6NDY0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PABPN1LA6NDY0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PABPN1LA6NDY0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PABPN1LA6NDY0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PABPN1LA6NDY0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PABPN1LA6NDY0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PABPN1LA6NDY0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PABPN1LA6NDY0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PABPN1LA6NDY0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PABPN1LA6NDY0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PABPN1LA6NDY0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PABPN1LA6NDY0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PABPN1LA6NDY0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PABPN1LA6NDY0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PABPN1LA6NDY0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PABPN1LA6NDY0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PABPN1LA6NDY0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PABPN1LA6NDY0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PABPN1LA6NDY0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PABPN1LA6NDY0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PABPN1LA6NDY0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PABPN1LA6NDY0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PABPN1LA6NDY0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PABPN1LA6NDY0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PABPN1LA6NDY0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PABPN1LA6NDY0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PABPN1LA6NDY0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PABPN1LA6NDY0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PABPN1LA6NDY0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PABPN1LA6NDY0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PABPN1LA6NDY0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PABPN1LA6NDY0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PABPN1LA6NDY0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PABPN1LA6NDY0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PABPN1LA6NDY0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PABPN1LA6NDY0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PABPN1LA6NDY0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PABPN1LA6NDY0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PABPN1LA6NDY0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PABPN1LA6NDY0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PABPN1LA6NDY0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PABPN1LA6NDY0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PABPN1LA6NDY0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PABPN1LA6NDY0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PABPN1LA6NDY0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PABPN1LA6NDY0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PABPN1LA6NDY0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PABPN1LA6NDY0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PABPN1LA6NDY0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PABPN1LA6NDY0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PABPN1LA6NDY0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PABPN1LA6NDY0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PABPN1LA6NDY0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PABPN1LA6NDY0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PABPN1LA6NDY0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PABPN1LA6NDY0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PABPN1LA6NDY0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PABPN1LA6NDY0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PABPN1LA6NDY0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PABPN1LA6NDY0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PABPN1LA6NDY0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PABPN1LA6NDY0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PABPN1LA6NDY0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PABPN1LA6NDY0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PABPN1LA6NDY0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PABPN1LA6NDY0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PABPN1LA6NDY0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PABPN1LA6NDY0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PABPN1LA6NDY0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PABPN1LA6NDY0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PABPN1LA6NDY0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PABPN1LA6NDY0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PABPN1LA6NDY0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PABPN1LA6NDY0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PABPN1LA6NDY0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PABPN1LA6NDY0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PABPN1LA6NDY0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PABPN1LA6NDY0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PABPN1LA6NDY0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PABPN1LA6NDY0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 230.1 ms