Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA6BA6NDN3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA6BA6NDN3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA6BA6NDN3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GOLGA6BA6NDN3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GOLGA6BA6NDN3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GOLGA6BA6NDN3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GOLGA6BA6NDN3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GOLGA6BA6NDN3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GOLGA6BA6NDN3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA6BA6NDN3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA6BA6NDN3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA6BA6NDN3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA6BA6NDN3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GOLGA6BA6NDN3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GOLGA6BA6NDN3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GOLGA6BA6NDN3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GOLGA6BA6NDN3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GOLGA6BA6NDN3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GOLGA6BA6NDN3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GOLGA6BA6NDN3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GOLGA6BA6NDN3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GOLGA6BA6NDN3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GOLGA6BA6NDN3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GOLGA6BA6NDN3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA6BA6NDN3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA6BA6NDN3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA6BA6NDN3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA6BA6NDN3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA6BA6NDN3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GOLGA6BA6NDN3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GOLGA6BA6NDN3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GOLGA6BA6NDN3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GOLGA6BA6NDN3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GOLGA6BA6NDN3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GOLGA6BA6NDN3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GOLGA6BA6NDN3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GOLGA6BA6NDN3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GOLGA6BA6NDN3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GOLGA6BA6NDN3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GOLGA6BA6NDN3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GOLGA6BA6NDN3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GOLGA6BA6NDN3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GOLGA6BA6NDN3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GOLGA6BA6NDN3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GOLGA6BA6NDN3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GOLGA6BA6NDN3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GOLGA6BA6NDN3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GOLGA6BA6NDN3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GOLGA6BA6NDN3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GOLGA6BA6NDN3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA6BA6NDN3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA6BA6NDN3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA6BA6NDN3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA6BA6NDN3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GOLGA6BA6NDN3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GOLGA6BA6NDN3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GOLGA6BA6NDN3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GOLGA6BA6NDN3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GOLGA6BA6NDN3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GOLGA6BA6NDN3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GOLGA6BA6NDN3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GOLGA6BA6NDN3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GOLGA6BA6NDN3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GOLGA6BA6NDN3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GOLGA6BA6NDN3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GOLGA6BA6NDN3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GOLGA6BA6NDN3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GOLGA6BA6NDN3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GOLGA6BA6NDN3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
GOLGA6BA6NDN3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GOLGA6BA6NDN3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GOLGA6BA6NDN3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GOLGA6BA6NDN3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GOLGA6BA6NDN3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GOLGA6BA6NDN3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GOLGA6BA6NDN3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GOLGA6BA6NDN3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GOLGA6BA6NDN3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GOLGA6BA6NDN3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA6BA6NDN3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA6BA6NDN3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA6BA6NDN3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA6BA6NDN3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA6BA6NDN3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA6BA6NDN3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA6BA6NDN3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA6BA6NDN3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA6BA6NDN3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA6BA6NDN3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA6BA6NDN3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA6BA6NDN3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA6BA6NDN3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA6BA6NDN3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA6BA6NDN3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA6BA6NDN3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA6BA6NDN3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA6BA6NDN3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA6BA6NDN3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA6BA6NDN3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms