Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB19A4D1S5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB19A4D1S5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB19A4D1S5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB19A4D1S5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB19A4D1S5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB19A4D1S5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB19A4D1S5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RAB19A4D1S5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RAB19A4D1S5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
RAB19A4D1S5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB19A4D1S5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB19A4D1S5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB19A4D1S5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB19A4D1S5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB19A4D1S5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB19A4D1S5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB19A4D1S5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB19A4D1S5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB19A4D1S5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB19A4D1S5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB19A4D1S5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB19A4D1S5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB19A4D1S5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB19A4D1S5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB19A4D1S5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB19A4D1S5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB19A4D1S5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB19A4D1S5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB19A4D1S5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB19A4D1S5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB19A4D1S5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB19A4D1S5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB19A4D1S5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB19A4D1S5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB19A4D1S5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB19A4D1S5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB19A4D1S5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB19A4D1S5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB19A4D1S5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB19A4D1S5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB19A4D1S5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB19A4D1S5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB19A4D1S5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB19A4D1S5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB19A4D1S5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB19A4D1S5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB19A4D1S5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB19A4D1S5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB19A4D1S5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB19A4D1S5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB19A4D1S5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB19A4D1S5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB19A4D1S5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB19A4D1S5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB19A4D1S5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB19A4D1S5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB19A4D1S5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB19A4D1S5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB19A4D1S5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB19A4D1S5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB19A4D1S5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB19A4D1S5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB19A4D1S5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB19A4D1S5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB19A4D1S5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB19A4D1S5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB19A4D1S5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB19A4D1S5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB19A4D1S5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB19A4D1S5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB19A4D1S5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB19A4D1S5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB19A4D1S5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RAB19A4D1S5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RAB19A4D1S5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RAB19A4D1S5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB19A4D1S5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB19A4D1S5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB19A4D1S5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB19A4D1S5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB19A4D1S5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB19A4D1S5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB19A4D1S5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RAB19A4D1S5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB19A4D1S5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB19A4D1S5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RAB19A4D1S5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB19A4D1S5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RAB19A4D1S5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RAB19A4D1S5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB19A4D1S5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB19A4D1S5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB19A4D1S5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB19A4D1S5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB19A4D1S5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB19A4D1S5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB19A4D1S5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB19A4D1S5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB19A4D1S5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms