Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC162PA2VCL2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC162PA2VCL2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC162PA2VCL2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC162PA2VCL2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC162PA2VCL2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC162PA2VCL2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC162PA2VCL2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC162PA2VCL2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC162PA2VCL2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC162PA2VCL2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC162PA2VCL2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC162PA2VCL2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC162PA2VCL2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC162PA2VCL2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC162PA2VCL2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC162PA2VCL2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC162PA2VCL2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC162PA2VCL2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC162PA2VCL2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC162PA2VCL2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC162PA2VCL2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC162PA2VCL2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC162PA2VCL2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC162PA2VCL2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC162PA2VCL2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC162PA2VCL2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC162PA2VCL2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC162PA2VCL2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC162PA2VCL2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC162PA2VCL2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC162PA2VCL2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC162PA2VCL2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC162PA2VCL2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC162PA2VCL2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC162PA2VCL2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC162PA2VCL2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC162PA2VCL2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC162PA2VCL2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC162PA2VCL2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC162PA2VCL2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC162PA2VCL2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC162PA2VCL2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC162PA2VCL2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC162PA2VCL2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC162PA2VCL2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC162PA2VCL2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC162PA2VCL2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC162PA2VCL2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC162PA2VCL2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC162PA2VCL2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC162PA2VCL2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC162PA2VCL2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC162PA2VCL2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC162PA2VCL2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC162PA2VCL2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC162PA2VCL2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC162PA2VCL2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC162PA2VCL2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC162PA2VCL2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC162PA2VCL2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC162PA2VCL2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC162PA2VCL2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC162PA2VCL2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC162PA2VCL2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC162PA2VCL2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC162PA2VCL2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC162PA2VCL2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC162PA2VCL2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC162PA2VCL2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC162PA2VCL2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC162PA2VCL2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC162PA2VCL2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC162PA2VCL2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC162PA2VCL2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC162PA2VCL2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC162PA2VCL2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC162PA2VCL2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC162PA2VCL2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC162PA2VCL2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC162PA2VCL2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC162PA2VCL2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC162PA2VCL2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC162PA2VCL2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC162PA2VCL2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC162PA2VCL2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC162PA2VCL2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC162PA2VCL2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC162PA2VCL2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC162PA2VCL2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC162PA2VCL2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC162PA2VCL2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC162PA2VCL2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC162PA2VCL2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC162PA2VCL2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC162PA2VCL2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC162PA2VCL2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC162PA2VCL2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC162PA2VCL2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC162PA2VCL2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms