Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPDC1A2A3K4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPDC1A2A3K4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPDC1A2A3K4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPDC1A2A3K4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPDC1A2A3K4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPDC1A2A3K4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPDC1A2A3K4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPDC1A2A3K4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPDC1A2A3K4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPDC1A2A3K4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPDC1A2A3K4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPDC1A2A3K4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPDC1A2A3K4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPDC1A2A3K4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPDC1A2A3K4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PTPDC1A2A3K4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPDC1A2A3K4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPDC1A2A3K4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPDC1A2A3K4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPDC1A2A3K4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPDC1A2A3K4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPDC1A2A3K4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPDC1A2A3K4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPDC1A2A3K4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPDC1A2A3K4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPDC1A2A3K4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPDC1A2A3K4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPDC1A2A3K4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPDC1A2A3K4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPDC1A2A3K4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPDC1A2A3K4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPDC1A2A3K4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPDC1A2A3K4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPDC1A2A3K4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPDC1A2A3K4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPDC1A2A3K4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPDC1A2A3K4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPDC1A2A3K4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPDC1A2A3K4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPDC1A2A3K4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPDC1A2A3K4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPDC1A2A3K4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPDC1A2A3K4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPDC1A2A3K4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPDC1A2A3K4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPDC1A2A3K4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPDC1A2A3K4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPDC1A2A3K4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPDC1A2A3K4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPDC1A2A3K4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPDC1A2A3K4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPDC1A2A3K4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPDC1A2A3K4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPDC1A2A3K4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPDC1A2A3K4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPDC1A2A3K4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPDC1A2A3K4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPDC1A2A3K4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPDC1A2A3K4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPDC1A2A3K4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPDC1A2A3K4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPDC1A2A3K4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPDC1A2A3K4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPDC1A2A3K4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPDC1A2A3K4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPDC1A2A3K4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPDC1A2A3K4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPDC1A2A3K4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPDC1A2A3K4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPDC1A2A3K4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPDC1A2A3K4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPDC1A2A3K4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPDC1A2A3K4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPDC1A2A3K4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPDC1A2A3K4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPDC1A2A3K4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPDC1A2A3K4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPDC1A2A3K4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPDC1A2A3K4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPDC1A2A3K4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPDC1A2A3K4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPDC1A2A3K4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPDC1A2A3K4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPDC1A2A3K4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPDC1A2A3K4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPDC1A2A3K4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPDC1A2A3K4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPDC1A2A3K4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPDC1A2A3K4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPDC1A2A3K4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPDC1A2A3K4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPDC1A2A3K4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPDC1A2A3K4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPDC1A2A3K4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPDC1A2A3K4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPDC1A2A3K4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPDC1A2A3K4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPDC1A2A3K4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPDC1A2A3K4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms