Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQJ8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQJ8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A0U1RQJ8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A0U1RQJ8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A0U1RQJ8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A0U1RQJ8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
A0A0U1RQJ8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
A0A0U1RQJ8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
A0A0U1RQJ8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
A0A0U1RQJ8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
A0A0U1RQJ8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
A0A0U1RQJ8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A0U1RQJ8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A0U1RQJ8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A0U1RQJ8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A0U1RQJ8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A0U1RQJ8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A0U1RQJ8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A0U1RQJ8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
A0A0U1RQJ8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
A0A0U1RQJ8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
A0A0U1RQJ8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
A0A0U1RQJ8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
A0A0U1RQJ8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
A0A0U1RQJ8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
A0A0U1RQJ8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
A0A0U1RQJ8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
A0A0U1RQJ8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
A0A0U1RQJ8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
A0A0U1RQJ8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
A0A0U1RQJ8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
A0A0U1RQJ8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
A0A0U1RQJ8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
A0A0U1RQJ8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
A0A0U1RQJ8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
A0A0U1RQJ8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
A0A0U1RQJ8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
A0A0U1RQJ8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
A0A0U1RQJ8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
A0A0U1RQJ8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
A0A0U1RQJ8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
A0A0U1RQJ8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
A0A0U1RQJ8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
A0A0U1RQJ8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
A0A0U1RQJ8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
A0A0U1RQJ8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
A0A0U1RQJ8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
A0A0U1RQJ8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
A0A0U1RQJ8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
A0A0U1RQJ8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
A0A0U1RQJ8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
A0A0U1RQJ8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
A0A0U1RQJ8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
A0A0U1RQJ8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
A0A0U1RQJ8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
A0A0U1RQJ8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
A0A0U1RQJ8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
A0A0U1RQJ8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
A0A0U1RQJ8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
A0A0U1RQJ8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
A0A0U1RQJ8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
A0A0U1RQJ8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
A0A0U1RQJ8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
A0A0U1RQJ8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
A0A0U1RQJ8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
A0A0U1RQJ8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
A0A0U1RQJ8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
A0A0U1RQJ8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
A0A0U1RQJ8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
A0A0U1RQJ8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
A0A0U1RQJ8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
A0A0U1RQJ8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
A0A0U1RQJ8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
A0A0U1RQJ8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
A0A0U1RQJ8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
A0A0U1RQJ8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
A0A0U1RQJ8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
A0A0U1RQJ8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
A0A0U1RQJ8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
A0A0U1RQJ8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
A0A0U1RQJ8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
A0A0U1RQJ8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
A0A0U1RQJ8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
A0A0U1RQJ8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
A0A0U1RQJ8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
A0A0U1RQJ8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
A0A0U1RQJ8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
A0A0U1RQJ8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
A0A0U1RQJ8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
A0A0U1RQJ8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
A0A0U1RQJ8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
A0A0U1RQJ8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
A0A0U1RQJ8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
A0A0U1RQJ8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
A0A0U1RQJ8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
A0A0U1RQJ8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
A0A0U1RQJ8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
A0A0U1RQJ8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
A0A0U1RQJ8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
A0A0U1RQJ8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
A0A0U1RQJ8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms