Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ARL2-SNX15V9GYD0 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
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