Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DKK2Q9UBU2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DKK2Q9UBU2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
DKK2Q9UBU2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DKK2Q9UBU2 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
DKK2Q9UBU2 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
DKK2Q9UBU2 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
DKK2Q9UBU2 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
DKK2Q9UBU2 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
DKK2Q9UBU2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
DKK2Q9UBU2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms